[发明专利]多肽鉴定的自步长学习方法在审
申请号: | 201710903787.6 | 申请日: | 2017-09-29 |
公开(公告)号: | CN107657282A | 公开(公告)日: | 2018-02-02 |
发明(设计)人: | 梁锡军;王永响;渐令;宋允全 | 申请(专利权)人: | 中国石油大学(华东) |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 266580 山东省青岛市*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多肽 鉴定 步长 学习方法 | ||
1.一种多肽鉴定的自步长学习方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1.数据预处理;
步骤2.求解如下形式的半监督学习模型:
其中,训练样本为xi∈Rd为数据库搜索引擎输出的多肽谱匹配,yi∈{-1,+1},诱骗PSM标签为“-1”,目标PSM标签为“+1”,Ω-={i|yi=-1},Ω+={i|yi=+1},β∈RN,θ=[θ1,...,θN]T∈RN是模型待求解的决策变量,θi∈[0,1]表征第i个样本标签的置信度,c1>0,c2>0,λ>0为模型参数,核矩阵Kij=k(xi,xj),k(·,·)为预先选取的核函数,Kj表示矩阵K的第j列;
步骤3.依据训练得出的分类器鉴定正确的多肽谱匹配。
2.如权利要求1所述的一种多肽鉴定的自步长学习方法,其特征在于,半监督学习模型(1)采用如下自步长学习方法求解:
步1.初始化:置β0=[0,...,0]T,θ0=[1,...,1]T,λ0=0,置k=0;
步2.调用标准的非线性规划算法,以(βk,θk)为算法初始点,置λ=λk,求解半监督学习模型(1),求解出的最优解置为(βk+1,θk+1);
步3.置λk+1=λk+μ,k←k+1,转步2,直至满足终止准则;
步4.输出β*←βk,θ*←θk。
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