[发明专利]检测胃癌预后情况的LncRNA组合及含有该组合的试剂盒

说明书

技术领域

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及检测胃癌预后情况的LncRNA组合及含有该组合的试剂盒。

背景技术

胃癌（GC）是胃黏膜腺上皮细胞发生的恶性肿瘤，多数为腺癌，是一种异质性很高的肿瘤，其临床表现和组织学形态差异巨大。目前，全球范围内最常见的恶性肿瘤之一就是胃癌。在我国胃癌发病人口和死亡人口均超过全球的40％死亡率。在医学手段干预条件下，预测疾病的近期和远期恢复或进展的程度对于患者生存或康复非常重要。传统的胃癌预后预测方法是基于患者年龄、肿瘤大小、淋巴结浸润及组织学分级等临床病例特征，也包括一些基因标记、血清学标记和细胞学标记等来进行个体复发转移风险的评估，但由于这些指标的特异性和敏感性各有差异，急需更好的方法对胃癌患者五年复发转移风险以及辅助化疗获益进行预测，使部分早期胃癌患者，避免痛苦的化疗。随着 RNA 作为肿瘤标志物的出现，提示在肿瘤发生发展过程中， RNA 比受体、蛋白等出现得更早，而这对肿瘤的诊断尤为重要。

肿瘤异质性包括时间和空间的异质性：同一肿瘤的不同区域，同种肿瘤的不同患者以及同一患者的不同治疗阶段，肿瘤均存在不同的生物学特征。由于恶性肿瘤异质性存在，使肿瘤组织内部出现不同亚型的肿瘤细胞，导致肿瘤在演进过程中的高度复杂性和多样性，其差异可使患者对化学药物敏感性或对放疗敏感性存在差异；此外也会使肿瘤的浸润和转移、生长速度、侵袭能力等表型方面存在差异。肿瘤异质性的存在往往给肿瘤的个体化诊断和治疗带来极大的困难。肿瘤异质性的发生机制虽未完全阐明，但基因不稳定性所起的作用则无庸置疑。基因检测作为研究热点，其在肿瘤的发生、发展、转移及预后等判断方面具有一定的优势。近年来发现，在哺乳动物细胞庞大的转录组中，存在着一类长度大于 200 nt，但并不具备编码蛋白或者只是编码很短多肽的基因转录产物，即长链非编码 RNA (Long noncoding RNA，LncRNA)。目前lncRNA 在肿瘤中的作用，分为致癌作用的 lncRNA 和抑癌作用的 lncRNA。它们参与肿瘤的周期、凋亡、转移以及对化疗的敏感性等多个过程。 LncRNA 同样具有作为肿瘤诊断的标志物和治疗靶点的潜力，例如 lncRNA DD3/PCA 已被开发成为前列腺癌核酸扩增性生物标记，比血清前列腺特异性抗原的特异性更高。

肿瘤是一个非常复杂的整体，其异质性存在给肿瘤的准确诊断和精准治疗带来了很多问题： 1）依据单一肿瘤标本活检，因其代表不了整块肿瘤，对于肿瘤细胞已经发生转移的患者而言，仅仅取某个部位的肿瘤组织，并不能反应患者的整体情况；2）对肿瘤样品取材时，病理医生常关注最坏的瘤组织，而对最具进展性、侵袭性区域则可能漏检；3）由检测标记物在肿瘤中异质性表达，以单一或两个检查标记物判断则更可能导致对病情进展了解不全面。

lncRNA与胃癌的发生发展有着密切的关系，并且可以在组织中稳定存在并被检测，符合临床标志物的要求。在现有发明申请号为201610717476.6、201710328860.1和201710069879.9中，lncRNA作为新型的肿瘤标志物用于肿瘤的辅助诊断和预后判断指标已被报道，但是它们只采用单个lncRNA作为诊断标记物；此外，还有发明申请 201510569987.3 只选取与胃癌相关的血清/血浆lncRNA标志物MALAT1和HOTAIR作为诊断标记物，随着对肿瘤异质性的深入研究，上述几种已无法避免肿瘤异质性可能带来的误诊，影响对病程的判断。因此，本发明对胃癌患者癌组织和癌旁中或患者血液中特异性表达的15个 LncRNA的表达情况进行了检测，并建立区分胃癌患者预后不良的诊断试剂盒。可以从基因水平全面提高对胃癌预后疗效及转移、复发预测的准确度。

鉴于目前对胃癌的诊断及治疗不全面的现状。本发明在转录水平上检测生物标志物的表达水平，增加检测标记物，避免肿瘤异质性带来的误诊，对胃癌预后诊断和治疗具有重要的临床指导意义。

发明内容

本发明的目的在于克服上述问题，提供一种增加检测标记物、提高检测准确度、减少误诊率的检测胃癌预后情况的LncRNA 组合及含有该组合的试剂盒。

为实现上述目的，本发明提供了检测胃癌预后情况的LncRNA组合，包括LINC00261、FENDRR、GAS5、LET、LncRNA-ATB、NEAT1、HOTAIR、ANRIL、CCAT2、LINC00668、PVT1、Sox2ot、TUG1、MALAT1、HIF1A-AS2分子中的一条或多条。