[发明专利]适用于药物基因组学的生物样本库管理系统

说明书

技术领域

本发明涉及药物基因组学领域，具体涉及一种适用于药物基因组 学的生物样本库管理系统。

背景技术

生物样本库(Biobank)又被称为生物银行，其作用在于对各类生物 样本的收集、处理、存储和应用过程进行标准化管理，同时对与样本 相关各类信息进行管理，如样本的临床信息、病人随访信息、样本质 量管理信息等。上个世纪以来，越来越多的生物样本库被建立，这些 生物样本库在基因组学研究和精准医疗研究红扮演着越来越重要的 角色。

随着生物样本库的不断发展状态，对于生物样本的管理工作愈显 繁重，传统的人工管理方式难以满足对当前生物样本库的管理工作。 同时，样本库数据的传输和交流也是当前解决的问题，传统样本数据 库分散在不同地区，研究者和管理者难以对样本的信息进行整合和汇 总统计。

因此，需要提供一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统 以解决上述问题。

发明内容

本发明的目的在于提供一种适用于药物基因组学的生物样本库 管理系统，该系统能实现以药物分类或基因分类为中心的样本管理、 在样本应用服务时能更好地满足临床药物基因组学的需求、以及可结 合疾病信息精准出库某一用药患者样本以提高科研效率。

本发明的技术方案如下：

一种适用于药物基因组学的生物样本库管理系统，包括：

数据库，包括样本表型数据库、疾病分类数据库、药物分类数据 库以及样本数据库；

样本信息采集模块，用于采集样本信息，所述样本信息包括样本 基本信息以及与被采集样本对应的疾病信息和用药信息；

知识库模块，包括基因本体单元、疾病ICD-10编码单元及药物 ATC编码单元，所述基因本体单元通过访问所述样本表型数据库以获 得所述样本基本信息的标准命名，所述疾病ICD-10编码单元通过访 问所述疾病分类数据库以获得所述疾病信息的标准命名，所述药物 ATC编码单元通过访问所述药物分类数据库以获得所述用药信息的标 准命名；

样本入库管理模块，用于根据所述样本基本信息、所述疾病信息 及所述用药信息三者的标准命名生成入库管理信息，并将所述入库管 理信息以及所述样本基本信息、所述疾病信息及所述用药信息三者的 标准命名关联后储存于所述样本数据库中，所述入库管理信息包括样 本编号信息以及储存位置信息；

样本出库管理模块，用于生成样本出库信息以及修改样本出库后 的样本状态；

样本应用服务模块，用于访问所述样本数据库中的所述样本基本 信息、所述疾病信息及所述用药信息中的任意一种或几种，以获得目 标数据，所述目标数据包括所述入库管理信息以及与所述入库管理信 息关联后的其他数据。

优选地，所述适用于药物基因组学的生物样本库管理系统还包括 样本质控管理模块，所述样本质控管理模块用于根据入库后样本的所 述入库管理信息将样本质检信息与所述入库管理信息关联后录入至 所述样本数据库中。

优选地，所述样本质检信息包括样本编号、检测类别、实验员信 息、检测结果以及实验日期。

优选地，所述样本编号信息为数字、条码及二维码中的任意一种。

优选地，所述样本信息采集模块还用于采集样本扩展信息，所述 样本入库管理模块还用于将所述样本扩展信息与所述入库管理信息 关联后储存至所述样本数据库中，所述样本扩展信息包括受试者的地 址、姓名、性别及年龄。

优选地，所述样本信息采集模块还用于采集样本处理信息，所述 样本入库管理模块还用于将所述样本处理信息与所述入库管理信息 关联后储存至所述样本数据库中，所述样本处理信息包括取样方法、 取样结果、样本处理时长、样本处理情况以及样本处理条件。

优选地，所述储存位置信息包括容器信息、冻存架信息、冻存盒 信息以及样本盒信息。

优选地，所述储存位置信息以图形化的方式显示样本的储存位 置。

优选地，所述样本出库信息包括出库单号、申请人信息、申请人 部门、申请用途、申请日期、样本所属的项目信息及申请理由。

优选地，所述样本应用服务模块还用于导出从所述样本数据库查 询得到的目标数据，所述目标数据包括所述入库管理信息以及与所述 入库管理信息关联后的其他数据。