[发明专利]一种用于肾透明细胞癌诊治的生物标志物在审

专利信息
申请号: 201711013993.6 申请日: 2017-10-26
公开(公告)号: CN107586842A 公开(公告)日: 2018-01-16
发明(设计)人: 宋宏涛;马翠;任静 申请(专利权)人: 北京泱深生物信息技术有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;A61K45/00;A61K31/7105;A61P35/00
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 透明 细胞 诊治 生物 标志
【说明书】:

技术领域

发明属于生物医药领域,涉及一种肾透明细胞癌miRNA标记物及其应用,更具体的涉及mir-2355及其成熟miRNA。

背景技术

肾细胞癌是泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一,约占成人恶性肿瘤的3%。肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是最常见和最具侵袭性的肾癌组织学亚型,占所有肾癌的75%~80%。对于早期和局限性ccRCC患者,手术仍是最有效的治疗方式,但是由于缺乏有效的生物学标记物,约有40%的确诊患者已处于晚期。早期或局限性肿瘤患者术后发生转移的概率也高达20%~40%,且肾透明细胞癌对放疗、化疗等常规的抗癌治疗不敏感,总体生存率很低。在我国肾癌发病率呈逐年增多的趋势,且向低龄化发展,半数患者首次就诊时已经是晚期。目前肾癌的治疗并不能取得令人满意的结果,肾癌未能手术切除者3年生存率不足5%,5年生存率在2%以下。因此,寻找一种能早期诊断及有效治疗肾癌的方法显得尤为重要,已经成为临床上迫切需要解决的实际问题。

MicroRNAs(miRNAs)是一类重要的非编码的小RNA,长度在19到25个核苷酸,在不同生理病理过程中调控基因的表达。包括发育时间、细胞分化、细胞凋亡、肿瘤发生发展等。成熟miRNAs的种子序列特异性结合与目标mRNA在3’-非编码区而促进目标mRNA断裂或抑制蛋白翻译。近年来研究发现miRNAs在肿瘤中的潜在作用,因此开辟了肿瘤治疗的新领域。

生物信息学(Bioinformatics)是利用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。在1970年,Paulien Hogeweg和Ben Hesper依据在生物系统中研究信息的处理提出了生物信息学。随着互联网的普及和人类基因组计划的完成,生物学数据库如雨后春笋般迅速出现和成长。但这些数据库许多仅仅提供了原始的生物信息资源,亟需科研工作者利用生物信息学进行深入的分析,从这些数据中挖掘出有价值的信息。简而言之,我们运用生物信息学可以从基因组相关生物信息中获取海量数据,然后对它们进行加工、分析和解释,从而可进一步认识生物的代谢、发育、分化、肿瘤形成等规律。鉴于肾癌逐渐成为严重危害人类生命和健康的常见肿瘤之一,而ccRCC是肾癌最常见的一种类型,本发明利用生物信息学分析ccRCC相关分子标志物,通过上述分析筛选ccRCC及癌旁组织差异表达基因,分析mir-2355及其成熟miRNA对ccRCC诊断、预后判断的价值,这为ccRCC诊断、预后及后续靶向治疗研究提供了基础。

发明内容

为了弥补现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种可用于诊治肾透明细胞癌的miRNA标记物。相比传统的肾透明细胞癌的诊断方法,使用miRNA标记物来诊断肾透明细胞癌具有及时性、灵敏性,从而使患者在疾病早期就能知晓疾病风险,从而采取相应的预防和治疗措施。

为了实现上述目的,本发明采用了如下技术方案:

本发明提供了mir-2355及其成熟miRNA在制备诊断肾透明细胞癌的产品中的应用。

所述mir-2355的序列见SEQ ID NO1:cagacgugucauccccagauacaauggacaauaugcuauuauaaucguauggcauuguccuugcuguuuggagauaauacugcugac。

所述mir-2355能在人细胞内被剪切并表达成其成熟miRNA,具体为miR-2355-5p或miR-2355-3p,序列见SEQ ID NO 2:auccccagauacaauggacaa和SEQ ID NO 3:auuguccuugcuguuuggagau。

应当知道,本发明的mir-2355及其成熟miRNA包括组成型核酸分子的功能等同物,即变体,其显示完整mir-2355及其成熟miRNA核酸分子相同的功能,它们可能通过核苷酸残基的缺失、置换或者插入而突变。

本发明的mir-2355是部分自互补的,以形成双链结构,其成熟miRNA核酸分子主要呈单链形式,本发明的核酸分子可以是RNA、DNA、PNA、LNA的形式。

本发明提供了mir-2355及其成熟miRNA在高通量测序平台中的应用。所述产品通过高通量测序技术、探针杂交技术、基因芯片技术或荧光定量PCR技术检测mir-2355及其成熟miRNA的表达水平。

进一步,所述荧光定量PCR技术包括特异性扩增mir-2355及其成熟miRNA的引物;所述基于探针杂交技术包括与mir-2355及其成熟miRNA的核酸序列杂交的探针。

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