[发明专利]一种简单快速检测易成花荔枝种质资源的方法在审
申请号: | 201711015173.0 | 申请日: | 2017-10-26 |
公开(公告)号: | CN107586873A | 公开(公告)日: | 2018-01-16 |
发明(设计)人: | 张树伟;丁峰;彭宏祥;陈厚彬 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院园艺研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京中誉威圣知识产权代理有限公司11279 | 代理人: | 朱志宽 |
地址: | 530007 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 简单 快速 检测 易成花 荔枝 种质 资源 方法 | ||
1.一种简单快速检测易成花荔枝种质资源的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)收集不同荔枝种质资源,并提取待检测荔枝的DNA;
(2)引物设计:在低温敏感型和低温不敏感型LcFT1基因启动子small indels突变两端相同的区域设计一对上下游引物LcCeED-F1和LcCeED-R1,用于鉴定易成花荔枝种质资源;引物LcCeED-F1和LcCeED-R1检测低温敏感型LcFT1基因启动子目的片段大小为446bp,其具有如Seq ID NO.3所示的序列;检测低温不敏感型LcFT1基因启动子目的片段大小为434bp,其具有如Seq ID NO.4所示的序列;
(3)PCR扩增:分别以待检测的荔枝DNA为模板进行PCR扩增,扩增的PCR产物经1.5%浓度的琼脂糖电泳检测;
(4)PCR产物毛细管电泳检测:取1μL的PCR产物分别加入9μL的去离子甲酰胺和1μL的GS3730-500分子量内标,95℃预变性5min,4℃再保温10min,然后通过ABI3730XL DNA分析仪进行毛细管电泳,再用GeneMarker V1.91 Demo软件进行分析生成图谱;
(5)易成花荔枝种质资源的鉴定分析:以待检测的荔枝DNA样品为模板进行PCR扩增,PCR扩增产物经毛细管电泳检测,如果在434bp处出现单一峰值,则表明待检测荔枝为LcFT1基因纯合低温不敏感型荔枝种质资源;如果在434bp和446bp处同时出现两个峰值,则表明待检测荔枝为LcFT1基因低温敏感型和低温不敏感型的杂合易成花荔枝种质资源;如果在446bp处出现单一峰值,则表明待检测荔枝为LcFT1基因纯合低温敏感型易成花荔枝种质资源。
2.根据权利要求1所述的简单快速检测易成花荔枝种质资源的方法,其特征在于,步骤(2)中所述的上游引物LcCeED-F1为Seq ID NO.1所示的序列,所述的下游引物LcCeED-R1为Seq ID NO.2所示的序列。
3.根据权利要求1所述的简单快速检测易成花荔枝种质资源的方法,其特征在于,步骤(2)中所述的PCR扩增的反应体系具体组成如下:2×Taq PCR MasterMix(TIANGEN)12.5μL,DNA模板1μL,上游引物1μL,下游引物1μL,水9.5μL,共25μL。
4.根据权利要求3所述的简单快速检测易成花荔枝种质资源的方法,其特征在于,所述的上游引物为Seq ID NO.1所示的序列,所述的下游引物为Seq ID NO.2所示的序列。
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