[发明专利]一种基于镉的功能核酸的可视化传感器及其应用有效
申请号: | 201711022150.2 | 申请日: | 2017-10-27 |
公开(公告)号: | CN107966436B | 公开(公告)日: | 2020-10-02 |
发明(设计)人: | 许文涛;罗云波;黄昆仑;田晶晶;肖冰;杜再慧;董凯 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 陈波 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 功能 核酸 可视化 传感器 及其 应用 | ||
1.一种基于镉的功能核酸的可视化传感器,包括分子识别元件、信号放大元件和信号转换元件,其特征在于,
所述分子识别元件包括镉离子脱氧核酶;所述镉离子脱氧核酶由底物链和酶链组成;
所述信号放大元件包括等温扩增体系和氯高铁血红素,
所述脱氧核酶底物链的序列(5’-3’)为:CTCACGAGTCACTATrA*GGAAGATGGCGAAACGGGGCCGG;
所述脱氧核酶酶链的序列(5’-3’)为:ATCTTCCTTCGATAGTTAAAATAGTGACTCGTGAC;
所述扩增模板的序列(5’-3’)为:CCCTACCCGCCCTACCCCCCTACCCGCCCTACCCAACTGACTCCCGGCCCCGTTTCGCCATCTTCC;
所述信号转换元件包括显色剂;所述等温扩增体系包括A体系和B体系;
所述A体系包括:扩增模板、dNTPs和镉离子脱氧核酶切割产物;
所述B体系包括:Bst DNA聚合酶及其缓冲溶液、Nt.BstNBI切刻内切酶及其缓冲溶液。
2.根据权利要求1所述的传感器,其特征在于,所述信号转换元件还包括终止剂,所述显色剂为TMB显色剂。
3.根据权利要求2所述的传感器,其特征在于,所述终止剂为硫酸。
4.一种检测镉离子的方法,其特征在于,包括如下步骤:
制备镉离子浓度和G-四链体功能核酸显色光密度关系的标准曲线;
按上述制备标准曲线的过程进行待测样品的检测,得到待测样品的G-四链体功能核酸显色光密度值,通过上述标准曲线计算镉离子的浓度;
其中,镉离子浓度和G-四链体功能核酸显色光密度关系的标准曲线的步骤包括:
(1)在镉离子脱氧核酶的底物链和酶链中加入不同浓度镉离子溶液,制备镉离子脱氧核酶切割产物;
所述脱氧核酶底物链的序列(5’-3’)为:CTCACGAGTCACTATrA*GGAAGATGGCGAAACGGGGCCGG;
所述脱氧核酶酶链的序列(5’-3’)为:ATCTTCCTTCGATAGTTAAAATAGTGACTCGTGAC;
(2)将扩增模板,dNTPs,镉离子脱氧核酶切割产物和超纯水混合均匀,制备A体系;将Bst DNA聚合酶及其缓冲溶液,Nt.BstNBI切刻内切酶及其缓冲溶液混合均匀,制备B体系;
所述扩增模板的序列(5’-3’)为:CCCTACCCGCCCTACCCCCCTACCCGCCCTACCCAACTGACTCCCGGCCCCGTTTCGCCATCTTCC;
(3)A体系先进行孵育,然后与B体系迅速进行混合,孵育扩增,终止反应后得到扩增产物;
(4)将扩增产物、酶活缓冲液和氯高铁血红素稀释溶液混匀并反应,形成G-四链体结构;
(5)向步骤(4)混合液中加入显色液,混匀并反应,反应结束后加入H2SO4,测定OD450值,得到OD450值随镉离子浓度变化的标准曲线。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤(1)的操作为:将镉离子脱氧核酶的底物链和酶链用缓冲液稀释,95℃加热15min,然后缓慢降至25℃;加入待测镉离子溶液,25℃孵育6min,加入终止液,得到镉离子脱氧核酶切割产物。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤(3)的操作为:A体系于95℃孵育5min,然后与B体系迅速进行混合,55℃孵育扩增20min,95℃保持10min以终止反应。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤(4)中反应温度为37℃,反应时间为30min;步骤(5)中反应温度为37℃,反应时间为10min。
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