[发明专利]一种基于G‑四链体的DNA传感器对Pb2+浓度的测试方法在审

专利信息
申请号: 201711022555.6 申请日: 2017-10-27
公开(公告)号: CN107607513A 公开(公告)日: 2018-01-19
发明(设计)人: 王公轲;邵超伟;王双莉;李丹;闫长领;陈得军 申请(专利权)人: 河南师范大学
主分类号: G01N21/64 分类号: G01N21/64
代理公司: 新乡市平原智汇知识产权代理事务所(普通合伙)41139 代理人: 路宽
地址: 453007 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 四链体 dna 传感器 pb2 浓度 测试 方法
【说明书】:

技术领域

发明属于DNA传感器技术领域,具体涉及一种基于G-四链体的DNA传感器对Pb2+浓度的测试方法。

背景技术

在水生生态系统中,铅离子是一种最具毒性的环境污染物之一,它严重威胁着人类的生命健康,因此,开发出具有超高灵敏度、能够定量检测铅离子的传感器具有非常重要的意义。然而,传统的检测方法,如原子吸收光谱(AAS)或电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)等,由于仪器本身昂贵、预处理过程繁琐等限制了它在现场和实时的检测之用。研究人员通过不断努力,在铅离子的检测方法上已经取得了巨大进步。其中一些电化学检测法也得到了实际应用,然而其处理过程相对复杂,对操作条件要求较高,因此难以推广使用。

在过去数年间,功能化的核酸成为了一种有力的检测工具并得到了广泛的应用。特别是两种基于铅离子的RNA裂解脱氧核糖核酸酶—8-17E DNAzyme和GR-5 DNAzyme,得到了普遍运用。它们的作用原理都是利用Pb2+的辅助作用激发酶的活性催化裂解有核糖核苷酸rA的DNA链,依据得到的荧光信号的变化来进行检测。不过这些检测平台大部分没能在实际中得到应用,因为酶的费用较高,处理过程也相对复杂,最关键的是RNA分子不太稳定。除此之外,Pb2+能够诱导G-四链体构象的变化这一现象也被应用到了对Pb2+的检测中来。如Dong课题组引入了一个Pb2+诱导形成G-四链体的DNA酶作为检测平台,但是他们需要用Hemin和H2O2作为辅因子,这可能也限制了它在实际中的应用。又比如,李想等人设计了另外一个方案,他们以氧化石墨烯(GO)作为淬灭剂,通过π-π作用吸附富G碱基的DNA,使修饰在DNA上的荧光基团与GO之间发生FRET作用,将其荧光猝灭,当加入Pb2+后诱导G-四链体的形成,使修饰有荧光基团的DNA脱离GO表面而恢复自身的荧光强度。基于这样的原理,他达到了检测Pb2+目的,虽然具有较好的检测效果,然而DNA的修饰和GO的制备过程比较复杂而且花费较高,同样不利于实际应用。而Zhang等人利用Pb2+诱导形成的G-四链体与荧光基团之间的猝灭作用来对Pb2+进行检测,这种方法虽然达到了0.4nM的检测限,但是也没有避开对DNA的荧光标记。

发明内容

本发明是以PS2.M做探针,首次实现了以Pb2+诱导G-四链体结构的变化来猝灭G-四链体-PPIX复合物荧光的实验设计,而且只通过“混合-检测”步骤就完成了对Pb2+的检测。此检测方法可操作性强,成本低廉、实用,能够满足日常检测要求,同时也具有非常好的灵敏度和选择性。

本发明采用的技术方案是,一种基于G-四链体的DNA传感器对Pb2+ 浓度的测试方法,包括以下步骤:

①配制含有探针DNA的混合溶液,有探针DNA的混合溶液包括50mM pH 6.0的Tris-HCl缓冲溶液,50mM KCl,10mM NaCl,0.5μM探针DNA,0~2000nM Pb2+;置于95℃的水浴中加热10分钟,之后缓慢冷却至室温;所述探针DNA的序列如SEQ ID NO:1 所示;

②向步骤①处理后不同Pb2+浓度下的含有探针DNA的混合溶液中加入等体积0.5μM的PPIX溶液,在暗处反应1h,最后用微量荧光比色皿在荧光光度计中测得其荧光光谱,激发波长设定为410nm,扫描范围为550nm-750nm,测定在632nm处的荧光强度值;PPIX的结构式如下:

③绘出不同浓度Pb2+下荧光强度值的标准工作曲线;

④将配制的待测Pb2+浓度的含有探针DNA的混合溶液置于95℃的水浴中加热10分钟,之后缓慢冷却至室温,加入等体积0.5μM的PPIX溶液,在暗处反应1h,最后用微量荧光比色皿在荧光光度计中测得其荧光光谱,激发波长设定为410nm,扫描范围为550nm-750nm,测定在632nm处的荧光强度值;根据步骤③的标准工作曲线,即可得出待测溶液的Pb2+浓度值。

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