[发明专利]胶质瘤诊断标志物Circ3:129880309|129880559及应用在审

专利信息
申请号: 201711024914.1 申请日: 2017-10-27
公开(公告)号: CN107586846A 公开(公告)日: 2018-01-16
发明(设计)人: 李沛瑶;武明花;孟舒娟;刘强;陈琼;余志斌;张严 申请(专利权)人: 中南大学湘雅医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/113
代理公司: 长沙市融智专利事务所43114 代理人: 袁靖
地址: 410008 湖*** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 胶质 诊断 标志 circ3 129880309 129880559 应用
【说明书】:

技术领域

发明属于生物技术领域,涉及一种用于胶质瘤诊断的血清circRNA标志物Circ3:129880309|129880559、以及检测该标志物的试剂用于制备胶质瘤诊断制剂的应用、还有试剂盒。

背景技术

脑胶质瘤是成年人最为频发的脑肿瘤疾病,占颅内肿瘤的40.49%。从确诊开始,脑胶质瘤患者平均生存寿命不超过五年。为了诊治胶质瘤这种与遗传物质相关性极高的恶性疾病,必须在分子生物学水平,从遗传信息表达的方面来探索其发病机理。目前而言胶质瘤的诊断和治疗方法虽处于不断改进阶段,但是胶质瘤患者生存率并没有明显提高。胶质瘤诊断仍然处于以临床、病理学和影像学信息为基础的经验性阶段,而且一经诊断,绝大多数均为中晚期,手术后的生存率不容乐观。因此,寻找胶质瘤诊断标志物对高危人群进行筛查,并相应地选择合理的后续治疗方案,提高生存率,是神经科学领域亟待解决研究任务。

环状RNA是一类广泛且多样地存在于哺乳动物细胞中、具有调控基因表达作用的内源性非编码RNA分子,具有共价闭合的环形结构,广泛存在于各种细胞中,也是继microRNA(miRNA)后RNA家族的最新研究热点。近年来,随着深度测序技术的广泛应用和生物物理和信息学技术的快速发展,人们发现人类许多外显子的转录本可被非线性地反向剪接或通过基因重排而形成环状RNA,且它们在所有剪接转录本中占了相当大的比例。近年来也逐渐发现外泌体中也含有大量的环状RNA,可能发挥重要作用。外泌体是指包含了复杂RNA和蛋白质的小膜泡(30-150nm),现今,其特指直径在40-100nm的盘状囊泡。1983年,外泌体首次于绵羊网织红细胞中被发现,1987年Johnstone将其命名为“exosome”。近年研究显示,外泌体是细胞与细胞间通讯的重要的分子,参与诸多生理与病理过程。外泌体中不仅包含蛋白质成分,还包括一些RNA成分,如微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA和mRNA、环状RNA(circular RNA,circRNA)。外泌体所携带的这些RNA统称为外泌体来源RNA,具有完整的序列结构和生物活性,有望作为液体活检分子标志物,在精准医学发展上有着光明的前景。

发明内容

本发明的第一个目的是:提供一种用于胶质瘤诊断的血清外泌体CircRNA标志物。

主要内容包括:一种用于胶质瘤诊断的血清外泌体CircRNA标志物Circ3:129880309|129880559,其序列如SEQ NO:1所示。

本发明的第二个目的是,提供检测所述的CircRNA标志物在血清外泌体中表达量的试剂在制备胶质瘤诊断制剂中的应用。

本发明的第三个目的是,提供一种胶质瘤诊断试剂盒,其能够测定血清外泌体中的Circ3:129880309|129880559的含量。

所述的胶质瘤诊断试剂盒,含有检测Circ3:129880309|129880559含量的PCR引物。优选引物的序列如SEQ NO:2和3所示。

所述的胶质瘤诊断试剂盒,除Circ3:129880309|129880559的引物外,还含有从血清中提取外泌体、由外泌体中提取RNA并进行逆转录及荧光定量PCR的所有试剂。

包括:

(1)提取血清外泌体所需试剂:Total Exosome Isolation Reagent(from serum),可由Invitrogen公司购得,货号4478360;

(2)提取外泌体RNA所需试剂:Trizol试剂、三氯甲烷、异丙醇、75%乙醇、无酶水;

(3)逆转录所需试剂:随机引物(Random Primer)、无酶水、5×逆转录缓冲液、三磷酸碱基脱氧核苷酸、RNA酶抑制剂、MMLV逆转录酶;

(4)荧光定量PCR所需试剂:Circ3:129880309|129880559上下游引物、GAPDH内参上下游引物、SYBR染料、无酶水。

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