[发明专利]细菌耐药性快速预测系统及其预测方法在审
申请号: | 201711038684.4 | 申请日: | 2017-10-30 |
公开(公告)号: | CN107604084A | 公开(公告)日: | 2018-01-19 |
发明(设计)人: | 张文萍;张秋萍;陆坚;单万水;赖文杰;肖颜玉;叶飞娣;张仲明;杨燕梅;刘厚明 | 申请(专利权)人: | 深圳市第三人民医院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12N15/10;G06F19/22;G06F19/18;G06F19/28 |
代理公司: | 长沙星耀专利事务所(普通合伙)43205 | 代理人: | 许伯严 |
地址: | 518114 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细菌 耐药性 快速 预测 系统 及其 方法 | ||
1.一种细菌耐药性快速预测系统,其特征在于:包括细菌基因组DNA提取设备、细菌基因组指纹分型设备、细菌耐药性表型检测设备、细菌耐药性表型数据采集分析设备、智能终端、云服务器和细菌数据库服务器,所述细菌基因组DNA提取设备与细菌基因组指纹分型设备连接,所述细菌耐药性表型检测设备和细菌耐药性表型数据采集分析设备连接,所述细菌基因组指纹分型设备和细菌耐药性表型数据采集分析设备通过线路或无线信号与智能终端连接,所述智能终端通过互联网与云服务器连接,所述云服务器与细菌数据库服务器加密连接,其中:
所述细菌基因组DNA提取设备,用于从待测细菌中提取基因组DNA;
所述细菌基因组指纹分型设备,用于从待测细菌基因组DNA中采集指纹信息,并将指纹
信息发送到智能终端;
所述细菌耐药性表型测定设备,用于测定细菌耐药表型;
所述细菌耐药性表型数据采集分析设备,用于采集并分析细菌耐药性表型数据,并将表型信息发送到智能终端;
所述智能终端,用于接收待测细菌基因组DNA指纹信息和细菌耐药性表型信息以及输入待测细菌的临床或环境分离信息,并将待测细菌基因组DNA指纹信息、细菌耐药性表型信息以及细菌的临床或环境分离信息上传到云服务器;
所述云服务器,用于接收智能终端上传的信息,并通过加密的方式访问和读取细菌数据库服务器,将待测细菌基因组DNA指纹信息和细菌耐药性表型信息与细菌数据库服务器存储的DNA指纹信息和表型信息进行分析比对,匹配后对待测细菌基因组DNA指纹信息及表型信息进行运算处理,自动完成对待测细菌菌株的抗生素耐药谱的预测,当细菌基因组DNA指纹信息一致而耐药性表型不一致时,提示为细菌异质性耐药,然后将抗生素耐药谱和抗生素用药指导信息反馈给智能终端。
2.根据权利要求1所述的细菌耐药性快速预测系统,其特征在于:所述细菌基因组指纹分型设备包括DNA凝胶电泳模块和DNA微阵列模块;所述DNA凝胶电泳模块,用于对待测细菌基因组DNA进行凝胶电泳并采集电泳指纹图谱;所述DNA微阵列模块,用于对待测细菌基因
组DNA进行斑点印迹分析并采集印迹指纹图谱。
3.根据权利要求1所述的细菌耐药性快速预测系统,其特征在于:所述细菌基因组DNA提取设备采用由台式离心机和试剂盒组成的手动DNA提取设备,或采用自动化核酸提取仪。
4.根据权利要求1所述的细菌耐药性快速预测系统,其特征在于:所述细菌耐药性表型测定设备采用药敏纸片、药敏卡或者能够测定细菌耐药性的微流控芯片等。
5.根据权利要求1所述的细菌耐药性快速预测系统,其特征在于:所述细菌数据库服务
器内部加密存储了细菌的生物特征,DNA指纹信息和细菌耐药性信息。
6.基于权利要求1所述细菌耐药性快速预测系统的预测方法,其特征在于:所述方法包
括以下步骤:
S1、细菌基因组DNA提取设备从待测细菌中提取基因组DNA;细菌基因组指纹分型设备从细菌基因组DNA提取设备提取的待测细菌基因组DNA中采集指纹信息,并将指纹信息发送到智能终端;所述指纹信息包括待测细菌基因组DNA的电泳指纹图谱和待测细菌基因组DNA的印迹指纹图谱;
S2、细菌耐药性表型测定设备测定细菌耐药表型,细菌耐药性表型数据采集分析设备,用于采集并分析细菌耐药性表型数据,并将表型信息发送到智能终端;
S3、智能终端接收待测细菌基因组DNA指纹信息和细菌耐药表型信息,并通过智能终端输入待测细菌的临床或环境分离信息,将待测细菌基因组DNA指纹信息以及细菌的临床或环境分离信息上传到云服务器;
S4、云服务器接收智能终端上传的信息,并通过加密的方式访问和读取细菌数据库服务器,将待测细菌基因组DNA指纹信息和细菌耐药表型信息与细菌数据库服务器存储的DNA指纹信息和细菌耐药表型信息进行分析比对,匹配后对待测细菌基因组DNA指纹信息进行运算处理,自动完成对待测细菌菌株的抗生素耐药谱的预测,当细菌基因组DNA指纹信息一致而耐药性表型不一致时,提示为细菌异质性耐药,然后将抗生素耐药谱和抗生素用药指导信息反馈给智能终端。
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