[发明专利]一种高斯软件输出文件自动化数据分析方法及装置有效
申请号: | 201711049654.3 | 申请日: | 2017-10-31 |
公开(公告)号: | CN107871056B | 公开(公告)日: | 2020-11-27 |
发明(设计)人: | 文明伟 | 申请(专利权)人: | 苏州浪潮智能科技有限公司 |
主分类号: | G16C20/90 | 分类号: | G16C20/90 |
代理公司: | 济南舜源专利事务所有限公司 37205 | 代理人: | 刘雪萍 |
地址: | 215100 江苏省苏州市吴*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 软件 输出 文件 自动化 数据 分析 方法 装置 | ||
本发明公开高斯软件输出文件自动化数据分析方法及装置,包括:读取高斯软件输出文件;查找循环标识;读取第一个循环标识与第二个循环标识之间的数据;根据作业类型分析本次读取数据是否符合要求;若符合要求则存储所读取的符合要求的数据;继续查找第三个循环标识;读取第二个循环标识与第三个循环标识之间的数据;根据作业类型分析本次读取数据是否符合要求;若符合要求则判断该次读取的符合要求的数据是否优于所存储的符合要求的数据,若是则将本次读取的符合要求的数据替换所存储的符合要求的数据进行存储;若否则舍弃本次读取的符合要求的数据;之后继续查找第四个循环标识,以此循环,直至读取完全部数据。本发明减少工作量,提高工作效率。
技术领域
本发明涉及高斯文件输出文件处理领域,具体涉及一种高斯软件输出文件自动化数据分析方法及装置。
背景技术
高斯(Gaussian)软件是目前计算化学领域内最流行、应用范围最广的综合性量子化学计算程序包。高斯软件基于量子力学而开发,它致力于把量子力学理论应用于实际问题,它可以通过一些基本命令验证和预测目标体系几乎所有的性质。其可执行程序可在不同型号的大型计算机,超级计算机,工作站和个人计算机上运行,并相应有不同的版本。此外,可视化软件GaussView的发布及计算机的快速发展更是大大降低了理论计算的门槛,使得各领域研究者能够轻松使用Gaussian研究和分析各种科学问题。
目前高斯输出文件分析工具只有高斯官方推出的Gaussview,该软件的功能主要是图形化的方式来显示分子优化后的构象,以及一些相关的作图功能。在可视化的查看分子构象方面该软件功能强大,但是在分析数据上面还有些欠缺,使用该软件虽然可以获取常用的各种数据,但是需要很多步骤,所需要的时间也比较长,在面对大量输出文件需要分析处理时,继续采用Gaussview的方式将变得不现实。
发明内容
为解决上述问题,本发明提供一种自动化分析高斯软件输出文件数据的方法及装置。
本发明的技术方案是:一种高斯软件输出文件自动化数据分析方法,包括以下步骤:
读取高斯软件输出文件;
查找循环标识;
读取第一个循环标识与第二个循环标识之间的数据;
根据作业类型分析本次读取数据是否符合要求;
若符合要求,则存储所读取的符合要求的数据;
分析完第一个循环标识与第二循环标识之间的数据后,继续查找第三个循环标识;
读取第二个循环标识与第三个循环标识之间的数据;
根据作业类型分析本次读取数据是否符合要求;
若符合要求,则判断该次读取的符合要求的数据是否优于所存储的符合要求的数据,若是,则将本次读取的符合要求的数据替换所存储的符合要求的数据进行存储;若否,则舍弃本次读取的符合要求的数据;
之后继续查找第四个循环标识,以此循环,直至读取完全部数据。
进一步地,所读取的高斯软件输出文件是高斯软件对甲烷分子进行优化后的输出文件。
进一步地,所查找循环标识为Standard orientation。
进一步地,作业类型为过渡态搜索任务。
进一步地,所读取数据为分子振动频率;读取数据是否符合要求的条件是分子振动频率是否为负值且唯一。
进一步地,作用类型为构象优化任务。
进一步地,所读取数据为分析坐标偏移;读取数据是否符合要求的条件是分子坐标偏移是否收敛。
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