[发明专利]一种基于层级结构信息构建细胞分割区域的方法及系统有效
申请号: | 201711059447.6 | 申请日: | 2017-11-01 |
公开(公告)号: | CN108122235B | 公开(公告)日: | 2020-11-20 |
发明(设计)人: | 陈磊;方陆明;吴超;徐爱俊;唐丽华;楼雄伟 | 申请(专利权)人: | 浙江农林大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/187 |
代理公司: | 宁波市鄞州盛飞专利代理事务所(特殊普通合伙) 33243 | 代理人: | 龙洋 |
地址: | 311300 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 层级 结构 信息 构建 细胞 分割 区域 方法 系统 | ||
本发明公开了一种基于层级结构信息构建细胞分割区域的方法及系统,用以解决现有技术不能准确地分割细胞区域的问题。该方法包括:S1、定义相差显微镜细胞图像中的主要信息、中间信息及次要信息;S2、基于所述细胞主要信息,扩展所述细胞中间信息;S3、基于细胞的灰度层级结构信息,检测与分析细胞之间各自独立与相互粘连的情况;S4、基于已检测到的相关信息,通过区域块分离与分组方法,不断扩展细胞信息以构建细胞最终的分割结果。本发明基于目标灰度层级结构信息构建细胞分割结果,不断地分离与分组具有不同重要性的灰度层级结构信息,最终能准确地构建细胞的分割区域。
技术领域
本发明涉及本发明涉及医学图像处理技术领域,尤其涉及一种基于层级结构信息构建细胞分割区域的方法及系统。
背景技术
细胞运动的研究一直是细胞学和生物学研究的重要组成部分,但是传统的研究方法在技术日益革新的现在已经渐渐变得不这么适用了,传统的在显微镜下利用细胞计数板用人眼进行染色、分类、计数、跟踪等这类不但需要大量繁琐的人为操作而且容易使得操作者变得疲劳从而影响结果的正确性,且其可重用性比较低。
国内外的医学专家经过长期地实践与研究取得一致共识认为应该在细胞运动研究中引入数字视频技术和数字图像处理技术,从而极大地提高研究效率,减轻研究人员负担。用计算机来跟踪细胞运动,部分代替人类始终盯着显微镜来观察细胞的眼睛,尽量地把人从繁重的重复劳动中解脱出来进行更有创造性的工作。
因此,如何利用计算机图像处理、视频分析等相关技术手段来提高生物研究过程中的自动化程度已成为当前急需解决的非常有意义的难题。
当前,常用的目标检测与识别算法,可以在确定目标大致位置之后,提取区域内部的特征,再采用适当的分类器对检测区域进行识别与分类。多数目标检测与识别算法的实现都是依赖于提取的高维度特征与不同的训练算法。在检测时,这些算法多采用矩形框,且将矩形框覆盖的大致区域作为表征目标的检测结果。虽然,其检测结果可以覆盖目标,但并不是在所有情况下都可以通过外接矩形框的方式定义目标区域。矩形框内目标占整个矩形框区域的比例有时非常小,那么提取的特征就不是非常准确,不利于应用目标识别与分类等后续算法。
公开号为CN103559724A的专利提供了一种高粘连度细胞环境下的多细胞同步跟踪方法。细胞序列图像中,多细胞的分割和同步跟踪是一个尚未解决的难题,尤其在高粘连度情况下多细胞检测与分割,更加迫切需要解决。该发明首先提出了一种改进的基于分水岭和多特征匹配的分割算法实现细胞分割,然后,建立适用于卡尔曼滤波的运动模型并加入多特征匹配实现细胞的预测和跟踪。该发明不能很好地处理细胞核粘连情况与独立情况的分析。
发明内容
本发明要解决的技术问题目的在于提供一种基于层级结构信息构建细胞分割区域的方法及系统,用以解决现有技术不能准确地分割细胞区域的问题。
为了实现上述目的,本发明采用的技术方案为:
一种基于层级结构信息构建细胞分割区域的方法,包括步骤:
S1、定义相差显微镜细胞图像中的细胞主要信息、细胞中间信息及细胞次要信息;具体地,通过相差显微镜成像系统,获取所述相差显微镜细胞图像;采用多类别最大类间方差算法将所述相差显微镜细胞图像划分为深暗区域、高亮区域及高亮区域内部的封闭区域;定义深暗区域为细胞主要信息,高亮区域为细胞次要信息,高亮区域内部的封闭区域为细胞中间信息;
S2、基于所述细胞主要信息,扩展所述细胞中间信息;
S3、基于细胞的灰度层级结构信息,检测与分析细胞之间各自独立与相互粘连的情况;
S4、基于已检测到的相关信息,通过区域块分离与分组方法,不断扩展细胞信息以构建细胞最终的分割结果。
进一步地,其特征在于,步骤S2具体包括:
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