[发明专利]PDGFRA基因突变检测体系及其试剂盒在审
申请号: | 201711094026.7 | 申请日: | 2017-11-09 |
公开(公告)号: | CN107904290A | 公开(公告)日: | 2018-04-13 |
发明(设计)人: | 王明;赵国玲 | 申请(专利权)人: | 上海赛安生物医药科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6886 |
代理公司: | 上海海颂知识产权代理事务所(普通合伙)31258 | 代理人: | 任益 |
地址: | 200436 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | pdgfra 基因突变 检测 体系 及其 试剂盒 | ||
1.一种PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:包括用于检测PDGFRA基因第12外显子V516D位点的上下游引物A,用于检测PDGFRA基因第18外显子D842V位点的上下游引物B,荧光染料SYBR Green,以及肽核酸;
所述上游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述下游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;
所述上游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,所述下游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;
所述肽核酸包括核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第12外显子V516D位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.5所示的肽核酸A,以及核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第18外显子D842V位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.6所示的肽核酸B。
2.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述上下游引物A、B进行了LNA修饰。
3.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述上下游引物A、B在反应体系中的最终浓度均为0.1~0.3μM/L。
4.根据权利要求3所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述上下游引物A在反应体系中的最终浓度为0.19μM/L,所述上下游引物B在反应体系中的最终浓度为0.2μM/L。
5.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述肽核酸A、B在反应体系中的最终浓度均为1~1.5μM/L。
6.根据权利要求5所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述肽核酸A、B在反应体系中的最终浓度均为1.25μM/L。
7.一种采用如权利要求1所述的检测体系的PDGFRA基因突变检测产品。
8.一种PDGFRA基因突变检测试剂盒,其特征在于:包括PCR检测液A、PCR检测液B和SYBR Green混合液;
所述PCR检测液A包括用于检测PDGFRA基因第12外显子V516D位点的上下游引物A和肽核酸A,所述PCR检测液B包括用于检测PDGFRA基因第18外显子D842V位点的上下游引物B和肽核酸B;
所述上游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述下游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,
所述上游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,所述下游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示,
所述肽核酸包括核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第12外显子V516D位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.5所示的肽核酸A,以及核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第18外显子D842V位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.6所示的肽核酸B。
9.根据权利要求8所述的PDGFRA基因突变检测试剂盒,其特征在于:所述上下游引物A、B进行了LNA修饰;所述上下游引物A、B在反应体系中的最终浓度均为0.1~0.3μM/L;所述肽核酸A、B在反应体系中的最终浓度均为1~1.5μM/L。
10.根据权利要求8所述的PDGFRA基因突变检测试剂盒,其特征在于:还包括阳性对照P1、阳性对照P2和阴性对照;
所述阳性对照液P1是浓度为100ng/μL的包含PDGFRA基因第12外显子V516D位点和第18外显子D842V位点的野生型质粒溶液;
所述阳性对照液P2是浓度为100ng/μL的包含PDGFRA基因第12外显子V516D位点和第18外显子D842V位点的突变型质粒溶液;
所述阴性对照液是不含PDGFRA基因的基因组DNA溶液。
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