[发明专利]PDGFRA基因突变检测体系及其试剂盒在审

专利信息
申请号: 201711094026.7 申请日: 2017-11-09
公开(公告)号: CN107904290A 公开(公告)日: 2018-04-13
发明(设计)人: 王明;赵国玲 申请(专利权)人: 上海赛安生物医药科技股份有限公司
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12Q1/6886
代理公司: 上海海颂知识产权代理事务所(普通合伙)31258 代理人: 任益
地址: 200436 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: pdgfra 基因突变 检测 体系 及其 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:包括用于检测PDGFRA基因第12外显子V516D位点的上下游引物A,用于检测PDGFRA基因第18外显子D842V位点的上下游引物B,荧光染料SYBR Green,以及肽核酸;

所述上游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述下游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;

所述上游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,所述下游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;

所述肽核酸包括核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第12外显子V516D位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.5所示的肽核酸A,以及核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第18外显子D842V位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.6所示的肽核酸B。

2.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述上下游引物A、B进行了LNA修饰。

3.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述上下游引物A、B在反应体系中的最终浓度均为0.1~0.3μM/L。

4.根据权利要求3所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述上下游引物A在反应体系中的最终浓度为0.19μM/L,所述上下游引物B在反应体系中的最终浓度为0.2μM/L。

5.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述肽核酸A、B在反应体系中的最终浓度均为1~1.5μM/L。

6.根据权利要求5所述的PDGFRA基因突变检测体系,其特征在于:所述肽核酸A、B在反应体系中的最终浓度均为1.25μM/L。

7.一种采用如权利要求1所述的检测体系的PDGFRA基因突变检测产品。

8.一种PDGFRA基因突变检测试剂盒,其特征在于:包括PCR检测液A、PCR检测液B和SYBR Green混合液;

所述PCR检测液A包括用于检测PDGFRA基因第12外显子V516D位点的上下游引物A和肽核酸A,所述PCR检测液B包括用于检测PDGFRA基因第18外显子D842V位点的上下游引物B和肽核酸B;

所述上游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述下游引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,

所述上游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,所述下游引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示,

所述肽核酸包括核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第12外显子V516D位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.5所示的肽核酸A,以及核苷酸序列与PDGFRA野生型基因第18外显子D842V位点完全互补且核苷酸序列如SEQ ID No.6所示的肽核酸B。

9.根据权利要求8所述的PDGFRA基因突变检测试剂盒,其特征在于:所述上下游引物A、B进行了LNA修饰;所述上下游引物A、B在反应体系中的最终浓度均为0.1~0.3μM/L;所述肽核酸A、B在反应体系中的最终浓度均为1~1.5μM/L。

10.根据权利要求8所述的PDGFRA基因突变检测试剂盒,其特征在于:还包括阳性对照P1、阳性对照P2和阴性对照;

所述阳性对照液P1是浓度为100ng/μL的包含PDGFRA基因第12外显子V516D位点和第18外显子D842V位点的野生型质粒溶液;

所述阳性对照液P2是浓度为100ng/μL的包含PDGFRA基因第12外显子V516D位点和第18外显子D842V位点的突变型质粒溶液;

所述阴性对照液是不含PDGFRA基因的基因组DNA溶液。

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