[发明专利]人源化基因改造动物模型的制备方法及应用有效
申请号: | 201711103773.2 | 申请日: | 2017-11-10 |
公开(公告)号: | CN108070614B | 公开(公告)日: | 2020-03-13 |
发明(设计)人: | 沈月雷;倪健;郭雅南;黄蕤;张美玲;赵磊;白阳 | 申请(专利权)人: | 北京百奥赛图基因生物技术有限公司 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/90;C12N15/113;C07K19/00;C12N15/62;C12N5/10;A01K67/027 |
代理公司: | 北京领科知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11690 | 代理人: | 杨晞 |
地址: | 101111 北京市大兴区经济*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 人源化 基因 改造 动物 模型 制备 方法 应用 | ||
1.一种用于TIM-3基因人源化的靶向载体,其包含:a)与待改变的转换区5’端同源的DNA片段,即5’臂,其选自TIM-3基因基因组DNA的100-10000个长度的核苷酸;b)插入或替换的供体DNA序列,其编码供体转换区;和c)与待改变的转换区3’端同源的第二个DNA片段,即3’臂,其选自TIM-3基因基因组DNA的100-10000个长度的核苷酸;其中,所述的待改变的转换区位于Tim-3基因第2号外显子,所述插入或替换的供体DNA序列包括人TIM-3基因DNA序列的第2号外显子的部分,所述人TIM-3基因DNA序列的第2号外显子的部分如SEQ ID NO:34所示。
2.根据权利要求1所述的靶向载体,其特征在于,a)所述与待改变的转换区5’端同源的DNA片段,即5’臂,其选自NCBI登录号为NC_000077.6的第46454902-46456260位核苷酸;c)所述与待改变的转换区3’端同源的第二个DNA片段即3’臂,其选自NCBI登录号为NC_000077.6的第46456585-46457884位核苷酸。
3.一种用于构建TIM-3基因人源化动物模型或TIM-3基因敲除动物模型的sgRNA序列,其特征在于,所述sgRNA序列靶向非人动物Tim-3基因,同时所述sgRNA在待改变的非人动物TIM-3基因上的靶序列上是唯一的,且按照5’-NNN(20)-NGG3’或5’-CCN-N(20)-3’的序列排列规则;其中,所述sgRNA在小鼠Tim-3基因的靶位点位于小鼠Tim-3基因的第2号外显子上,sgRNA靶向的5’端靶位点的序列如SEQ ID NO:1-6任一项所示,sgRNA靶向的3’端靶位点的序列如SEQ ID NO:7-13任一项所示。
4.根据权利要求3所述的sgRNA序列,其特征在于,所述非人动物为啮齿动物,所述啮齿动物为小鼠。
5.根据权利要求4所述的sgRNA序列,其特征在于,sgRNA靶向的5’端靶位点的序列如SEQ ID NO:3所示,sgRNA靶向的3’端靶位点的序列如SEQ ID NO:8所示。
6.根据权利要求5所述的sgRNA序列,其特征在于,其识别5’端靶位点的sgRNA序列选自SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:17;其识别3’端靶位点的sgRNA序列选自SEQ ID NO:18和SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:21。
7.一种包含权利要求3-6任一所述sgRNA序列的构建体。
8.一种包含权利要求3-6任一所述sgRNA序列的载体的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提供一种sgRNA序列,制备获得正向寡核苷酸序列和反向寡核苷酸序列,所述sgRNA序列靶向非人动物Tim-3基因,同时所述sgRNA在待改变的非人动物Tim-3基因上的靶序列上是唯一的,且符合5’-NNN(20)-NGG3’或5’-CCN-N(20)-3’的序列排列规则;
(2)合成含有T7启动子及sgRNA scaffold的片段DNA,并将所述片段DNA通过EcoRI和BamHI酶切连接至骨架载体上,经测序验证,获得pT7-sgRNA载体;
(3)将步骤(1)获得的正向寡核苷酸和反向寡核苷酸变性、退火,形成可以连入步骤(2)所述的pT7-sgRNA载体的双链;
(4)将步骤(3)中退火的双链sgRNA寡聚核苷酸分别与pT7-sgRNA载体进行链接,筛选获得sgRNA载体。
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