[发明专利]肺癌标志物及其应用有效
申请号: | 201711114229.8 | 申请日: | 2017-11-13 |
公开(公告)号: | CN108070656B | 公开(公告)日: | 2021-11-09 |
发明(设计)人: | 王子榕;刘华勇;袁剑颖;李英镇 | 申请(专利权)人: | 深圳华大因源医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12M1/00;C12M1/34;C12N15/11 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 518057 广东省深圳市南山区粤海街道高新区社区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺癌 标志 及其 应用 | ||
1.一组肺癌标志物,其特征在于,由下列细菌组成:Haemophilus_influenzae,Corynebacterium_argentoratense,Fusobacterium_sp._4_8,Capnocytophaga_ochracea,Staphylococcus_epidermidis,Campylobacter_concisus,Streptococcus_sp._I-P16,Fusobacterium_nucleatum,Acidovorax_sp._JS42,Bacteroides_salanitronis;
其中,所述细菌来自肺泡灌洗液。
2.试剂在制备试剂盒中的用途,所述试剂盒用于诊断肺癌或者评估肺癌风险,所述试剂用于检测下列细菌:Haemophilus_influenzae,Corynebacterium_argentoratense,Fusobacterium_sp._4_8,Capnocytophaga_ochracea,Staphylococcus_epidermidis,Campylobacter_concisus,Streptococcus_sp._I-P16,Fusobacterium_nucleatum,Acidovorax_sp._JS42,Bacteroides_salanitronis,
其中,所述细菌来自肺泡灌洗液。
3.一种诊断肺癌或者评估肺癌风险的系统,其特征在于,包括:
测定装置,所述测定装置用于确定待诊断对象的样本中权利要求1所述标志物的相对丰度;
确定装置,所述确定装置用于基于所述测定装置中所得到的所述标志物相对丰度,确定所述对象的诊断结果,
其中,所述样本为肺泡灌洗液;
所述确定装置包括适用于执行以下操作的模块:
所述标志物相对丰度输入多元统计模型,得到患病概率;
将所述患病概率与预定阈值比较,所述患病概率高于预定阈值,是所述对象患有肺癌或肺癌高风险的指示,
所述多元统计模型为随机森林模型,
所述随机森林模型是基于已知肺癌患者和非肺癌对照群体构建的。
4.根据权利要求3所述的系统,其特征在于,所述预定阈值是0.5。
5.根据权利要求3所述的系统,其特征在于,所述测定装置包括适于执行测序的模块。
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