[发明专利]芒果HMGR基因、用于克隆芒果HMGR基因的引物及其克隆方法有效

专利信息
申请号: 201711134678.9 申请日: 2017-11-16
公开(公告)号: CN107828804B 公开(公告)日: 2021-02-02
发明(设计)人: 李昌宝;易萍;孙健;辛明;唐雅园;李丽;何雪梅;刘国明;郑凤锦;李杰民;零东宁;盛金凤;李志春 申请(专利权)人: 广西壮族自治区农业科学院农产品加工研究所
主分类号: C12N15/53 分类号: C12N15/53;C12N9/04;C12N15/11;C12N15/10
代理公司: 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 代理人: 韦玲双
地址: 530007 广西*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 芒果 hmgr 基因 用于 克隆 引物 及其 方法
【说明书】:

发明涉及生物技术领域,具体涉及一种芒果HMGR基因、用于克隆芒果HMGR基因的引物及其克隆方法,该基因的核苷酸序列为SEQ ID NO:1;克隆步骤:对芒果的总RNA进行提取和逆转录合成cDNA第一链;芒果的HMGR基因5′‑RACE和3′‑RACE扩增;芒果的HMGR基因全长cDNA扩增;PCR克隆产物的纯化与筛选;本发明方法首次获得芒果HMGR基因的cDNA序列全长,同时通过一种克隆芒果HMGR基因的引物组和克隆方法,它能快速准确地克隆芒果HMGR基因的编码序列,为后续芒果HMGR基因分子研究提供了理论基础。

技术领域

本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种芒果HMGR基因、用于克隆芒果HMGR基因的引物及其克隆方法。

背景技术

芒果(Mangifera indica L.)为漆树科芒果属热带常绿果树,原产印度及马来西亚等地区,在我国主要集中分布于海南、广东、广西、云南等南方省区。近年来全球芒果年产量约2700万吨,已经成为世界许多地区的主要产业经济支柱,我国芒果产量一直位居世界前列,并呈现增长的趋势(李日旺等,2013)。芒果色、香、味俱佳,深受消费者青睐,其中香气这一品质特征越来越受到消费者以及品质育种学家的重视,因此香气成分成为评价芒果果实品质的重要指标之一(郭安,2006)。先前的研究发现,芒果果实中存在至少300多种香气成分,主要有单萜、倍半萜、醇类、酸类、酮类、酯类、酸类等,其中,萜类物质是芒果主要的风味物质,往往达到总挥发性香气物质的70%-90%左右,根据单萜与倍半萜的优势关系又分为单萜主导型和倍半萜主导型(张劲,2011;Jorge等,2005)。许多萜类被认为是通过甲羟戊酸途径(Mevalonate pathway,MVA pathway)合成的(马靓等,2006)。

3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methylglutarylcoenzyme A reductase, HMGR)属于MVA途径中的一个关键酶,催化HMG-CoA产生甲羟戊酸(mevalonic acid, MVA),这步反应是不可逆的,因此HMGR被认为是MVA途径中第一个重要的限速酶,也是MVA途径的重要调控点(Chappell等,1995)。研究表明,HMGR基因在很多植物中以基因家族的形式存在(Choi等,1992;Yang等,1991),目前在苹果、番茄、菠萝、荔枝等植物中克隆出该基因,但是在芒果中HMGR基因的研究至今还未发现有报道。因此,克隆芒果HMGR基因是相当有必要的,为后续深入研究芒果HMGR基因在果实成熟期间香气形成的特异性表达提供基础。

发明内容

本发明的发明目的在于提供一种芒果HMGR基因、用于克隆芒果HMGR基因的引物及其克隆方法。

为了实现上述发明目的,本发明采用的技术方案如下:

芒果HMGR基因,该基因的核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示。

进一步说明,所述芒果HMGR基因编码的蛋白质,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。

进一步说明,所述芒果HMGR基因的克隆引物组引物序列如下:

HMGR-F:5′-aatgccgtcttcttcaccgtcttc-3′,

HMGR-R:5′-ttccttgatgctgctgcctacttg-3′;

UPM:5′-ctaatacgactcactatagggcaagcagtggtatcaacgcagagt-3′;

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