[发明专利]一种与小麦苗期根系性状相关的SNP标记及应用有效

专利信息
申请号: 201711156638.4 申请日: 2017-11-20
公开(公告)号: CN107805673B 公开(公告)日: 2020-06-05
发明(设计)人: 何中虎;杨梦娇;王彩荣;肖永贵;夏先春 申请(专利权)人: 中国农业科学院作物科学研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅;白艳
地址: 100081 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 小麦 苗期 根系 性状 相关 snp 标记 应用
【权利要求书】:

1.检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦根系性状中的应用;

所述AX-110602569-7A基因的核苷酸序列为序列4;

所述小麦根系性状为总根长;

所述AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC或TT或CT。

2.检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在选育总根长延长的小麦中的应用;

所述AX-110602569-7A基因的核苷酸序列为序列4;

所述AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC或TT或CT。

3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于:

所述检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质如下1)或2):

1)为成套引物,所述成套引物由序列表中序列1所示的单链DNA分子或其衍生物、序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成;

2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒;

所述序列表中序列1所示的单链DNA分子的衍生物为序列1所示的单链DNA分子的5'端连接一种荧光序列;

所述序列表中序列2所示的单链DNA分子的衍生物为序列表中序列2所示的单链DNA分子的5'端连接另一种荧光序列;

所述荧光序列为序列5所示的特异荧光序列FAM或序列6所示的特异荧光序列HEX。

4.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于:所述小麦根系性状为小麦苗期根系性状。

5.一种鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的方法,为检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT,基因型为CC的待测小麦总根长大于基因型为TT或CT的待测小麦总根长;

或一种选育根系性状好的小麦的方法,为检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT,选择基因型为CC的小麦进行选育,得到目的小麦;

所述AX-110602569-7A基因的核苷酸序列为序列4;

所述小麦根系性状为总根长。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:

所述检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT的方法为用权利要求3中的所述成套引物对待测小麦基因组DNA进行PCR扩增产物,对所述PCR扩增产物进行基因分型。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:

所述基因分型的方法为采用荧光酶标仪照射后,若所述PCR产物仅显示序列1所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色,则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC;若所述PCR产物仅显示序列表中序列2所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色,则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为TT;

若所述PCR产物显示序列1所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色和序列表中序列2所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色,则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CT。

8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:所述小麦根系性状为小麦苗期根系性状。

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