[发明专利]一种并行分离核酸片断的拼接算法及其应用

权利要求书

1.一种并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，包括：

步骤120：选择通道i，对内标信号进行峰识别，记录各峰的位置；

步骤130：将内标信号的峰位按照从小到大的顺序排列；

步骤140：根据各通道信号特征，选择相应的峰位，从而确定各通道的信号提取范围；

步骤150：提取通道i对应的范围内的除内标以外的其余信号；

步骤160：计算通道i的电泳电压V_i与通道1电泳电压V₁的比例k_i；

步骤170：将步骤150提取的所述信号根据所述比例k_i进行伸缩变换，以使得通道i与通道1的所述信号的一致；

步骤180：重复步骤120-170，得到所有通道经过伸缩后的结果；

步骤190：根据通道顺序，将各通道保存的结果进行拼接，得到完整的基因片断信息；

所述并行分离核酸片断的方法包括：将待检测核酸分割为含有多个核酸片断的片断组合物，所述片断组合物带有荧光染料标记，使用多通道毛细管阵列电泳仪对所述片断组合物进行多通道同时检测，根据预设的每个通道所要检测的核酸片断的长度区间调整每个通道两端的电压大小，以使得各通道中所述预设的所要检测的核酸片断的电泳的迁移速率接近相同；采集各通道的电泳结果信息并进行拼接，得到完整的待检测核酸信息，

在检测时，各通道中还要加入分子量内标DNA片断；

所述并行分离核酸片断的拼接算法应用于检测特定基因座的有无以及STR分型。

2.根据权利要求1所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，在步骤120之前，还包括步骤110：对各通道中内标信号进行去噪和平滑处理。

3.根据权利要求1所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，当所述待检测核酸为DNA时，所述将待检测核酸分割为含有多个核酸片断的片断组合物的方法为PCR法；

当所述待检测核酸为RNA时，先进行逆转录，再利用PCR法将待检测核酸分割为含有多个核酸片断的片断组合物。

4.根据权利要求1所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，所述荧光染料标记于所述待检测核酸中的待检基因座上。

5.根据权利要求4所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，

将所述荧光染料标记在每个基因座中一条引物的5’端。

6.根据权利要求5所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，扩增片断不重叠的基因座使用相同的荧光染料进行标记，扩增片断重叠的基因座使用不同的荧光染料进行标记。

7.根据权利要求5或6所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，所述荧光染料包括FAM、VIC、NED、PET、LIZ、dR110、TAMRA、ROX、JOE、HEX、TET中的多种。

8.根据权利要求1所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，所述核酸片断的长度区间分区的数目≤所述多通道毛细管阵列电泳仪的最大通道数目。

9.根据权利要求1所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，所述待检测核酸的片断大小为100bp-20kb。

10.根据权利要求1所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，所述待检测核酸的片断大小为100bp-3kb。

11.根据权利要求1所述的并行分离核酸片断的拼接算法，其特征在于，所述待检测核酸的片断大小为100bp-500bp。