[发明专利]与桃果皮绒毛性状相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了与桃果皮绒毛性状相关的SNP标记及其应用。本发明提供了三个与桃果皮绒毛性状相关的SNP分子标记及成套的KASP引物组合，可用于桃育种材料果皮性状及果实油桃和毛桃表型的快速鉴定。本发明的鉴定方法成本低、结果准确可靠、操作简单周期短，利于大样本量的检测，在桃新品种的果实绒毛性状及果实油桃和毛桃表型的预测上有重要的意义，能有效提升桃育种效率和准确性。

技术领域

本发明属于农业生物技术领域，具体的说，涉及与桃果皮绒毛性状相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

桃(Prunus persica)是我国重要的果树类型之一，近年来随着育种技术的提升，越来越多的新品种育成并成功投放到市场上，一方面满足了人们日益增长的品质需求，更重要的是带来了可观的经济和社会效益。油桃品种起源于中国的西北部，由于其没有表皮的绒毛，可溶性固形物、可滴定酸的含量、去皮硬度、抗旱性、抗紫外辐射等性状都有所提升，因此油桃新品种已经成为桃育种研究的重要方向，利用油桃改善果实的品质和风味已经成为有效的手段。

近年来分子标记辅助育种技术不断用于桃的研究，遗传图谱定位、全基因组关联分析、混池测序分析、转录组分析等手段不断用于桃的性状定位研究，结果表明桃果皮的绒毛是单基因调控的性状，无毛是由隐性基因控制的，且是微小的结构变异导致，但是其机理还是不甚清楚，对于油桃品种的选育，也发展了部分的SSR、SNP等分子标记，其中SSR分子标记位点少、预测准确度低、实验繁琐；SNP分子标记由于遗传稳定、密度高等优点虽然是被认为分子标记辅助育种最有前景的标记，但是在桃表型性状关联上都是单个标记，对于表型的预测效率及准确性低。随着桃SNP分型的高通量测序技术的发展及高密度基因芯片的普及及应用，运用组合的SNP分子标记用于桃果实的表型鉴定的技术成为可能。其中，KASP(Kompetitive Allele Specific PCR，竞争性等位基因特异性PCR)可以对基因组DNA的SNP和InDel进行精准的双等位基因分型，该技术具有成本低、高通量、速度快、灵敏度高、周期短等优点，使得其成为针对少量位点多个样本进行现代农业分子育种的有效手段。

发明内容

本发明的第一个目的是提供一种检测待测桃树基因组的g.13627556位点、g.16646429位点和g.16980999位点的基因型的物质的新用途。

本发明提供了检测待测桃树基因组的g.13627556位点、g.16646429位点和g.16980999位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实为油桃还是毛桃中的应用。

本发明还提供了检测待测桃树基因组的g.13627556位点、g.16646429位点和g.16980999位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实为油桃还是毛桃的产品中的应用。

本发明还提供了检测待测桃树基因组的g.13627556位点、g.16646429位点和g.16980999位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实绒毛性状中的应用。

本发明还提供了检测待测桃树基因组的g.13627556位点、g.16646429位点和g.16980999位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实绒毛性状的产品中的应用。

本发明的第二个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实为油桃还是毛桃的方法。

本发明提供的鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实为油桃还是毛桃的方法包括如下步骤：

1)检测待测桃树基因组的g.13627556位点、g.16646429位点和g.16980999位点的基因型，分别根据每个所述位点的基因型判断所述待测桃树的果实为油桃还是毛桃：

若所述待测桃树基因组的g.13627556位点的基因型为CC，则该待测桃树的果实为油桃，若所述待测桃树基因组的g.13627556位点的基因型为TC或TT，则该待测桃树的果实为毛桃；