[发明专利]一组用于肾细胞癌分子分型的基因及其应用有效
申请号: | 201711216563.4 | 申请日: | 2017-11-28 |
公开(公告)号: | CN107723368B | 公开(公告)日: | 2021-04-23 |
发明(设计)人: | 徐清华;陈成书;陈金影;孙益丰;吴益旺;杨扬;蔡虎;钱琛辉;杨明;沈佳 | 申请(专利权)人: | 杭州可帮基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 上海市汇业律师事务所 31325 | 代理人: | 王函 |
地址: | 311199 浙江省杭州市余杭区钱*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 用于 细胞 分子 基因 及其 应用 | ||
1.一组用于肾细胞癌分子分型的基因,其特征在于,为如下44个基因:RHCG基因、RNF128基因、TMEM255A基因、PCP4基因、DHRS2基因、CLDN8基因、AQP6基因、SLC18A2基因、KRT7基因、SERPINA5基因、SFTPB基因、DEFB1基因、MAL基因、ANGPTL4基因、LCN2基因、PLIN2基因、ZNF395基因、TACSTD2基因、NDUFA4L2基因、NNMT基因、HILPDA基因、UMOD基因、SLC12A1基因、CALB1基因、C7基因、S100A2基因、ASS1基因、MT1G基因、ABCA8基因、FOSB基因、MAOB基因、STAP1基因、TFPI2基因、AKR1C2基因、IGFBP6基因、VCAN基因、FLRT3基因、MMP7基因、GSTA1基因、CRYAB基因、PAH基因、IGFBP1基因、ATP6V0A4基因、ALDOB基因;所述肾细胞癌分子分型为嗜酸细胞腺瘤、透明细胞癌、乳头状细胞癌和嫌色细胞癌。
2.如权利要求1所述的基因,其特征在于,所述44个基因的转录本序列依次分别为:SEQID NO.133- SEQ ID NO.176。
3.检测如权利要求1-2任一项所述的一组用于肾细胞癌分子分型的基因的试剂在制备用于肾细胞癌分子分型的试剂盒中的应用。
4.一种用于肾细胞癌分子分型的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含检测如下生物标志物的PCR引物组或探针,所述生物标志物为权利要求1-2任一项所述的一组用于肾细胞癌分子分型的基因。
5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR引物组为:
RHCG基因:正向引物如SEQ ID NO.1所示,反向引物如SEQ ID NO.2所示;
RNF128基因:正向引物如SEQ ID NO.3所示,反向引物如SEQ ID NO.4所示;
TMEM255A基因:正向引物如SEQ ID NO.5所示,反向引物如SEQ ID NO.6所示;
PCP4基因:正向引物如SEQ ID NO.7所示,反向引物如SEQ ID NO.8所示;
DHRS2基因:正向引物如SEQ ID NO.9所示,反向引物如SEQ ID NO.10所示;
CLDN8基因:正向引物如SEQ ID NO.11所示,反向引物如SEQ ID NO.12所示;
AQP6基因:正向引物如SEQ ID NO.13所示,反向引物如SEQ ID NO.14所示;
SLC18A2基因:正向引物如SEQ ID NO.15所示,反向引物如SEQ ID NO.16所示;
KRT7基因:正向引物如SEQ ID NO.17所示,反向引物如SEQ ID NO.18所示;
SERPINA5基因:正向引物如SEQ ID NO.19所示,反向引物如SEQ ID NO.20所示;
SFTPB基因:正向引物如SEQ ID NO.21所示,反向引物如SEQ ID NO.22所示;
DEFB1基因:正向引物如SEQ ID NO.23所示,反向引物如SEQ ID NO.24所示;
MAL基因:正向引物如SEQ ID NO.25所示,反向引物如SEQ ID NO.26所示;
ANGPTL4基因:正向引物如SEQ ID NO.27所示,反向引物如SEQ ID NO.28所示;
LCN2基因:正向引物如SEQ ID NO.29所示,反向引物如SEQ ID NO.30所示;
PLIN2基因:正向引物如SEQ ID NO.31所示,反向引物如SEQ ID NO.32所示;
ZNF395基因:正向引物如SEQ ID NO.33所示,反向引物如SEQ ID NO.34所示;
TACSTD2基因:正向引物如SEQ ID NO.35所示,反向引物如SEQ ID NO.36所示;
NDUFA4L2基因:正向引物如SEQ ID NO.37所示,反向引物如SEQ ID NO.38所示;
NNMT基因:正向引物如SEQ ID NO.39所示,反向引物如SEQ ID NO.40所示;
HILPDA基因:正向引物如SEQ ID NO.41所示,反向引物如SEQ ID NO.42所示;
UMOD基因:正向引物如SEQ ID NO.43所示,反向引物如SEQ ID NO.44所示;
SLC12A1基因:正向引物如SEQ ID NO.45所示,反向引物如SEQ ID NO.46所示;
CALB1基因:正向引物如SEQ ID NO.47所示,反向引物如SEQ ID NO.48所示;
C7基因:正向引物如SEQ ID NO.49所示,反向引物如SEQ ID NO.50所示;
S100A2基因:正向引物如SEQ ID NO.51所示,反向引物如SEQ ID NO.52所示;
ASS1基因:正向引物如SEQ ID NO.53所示,反向引物如SEQ ID NO.54所示;
MT1G基因:正向引物如SEQ ID NO.55所示,反向引物如SEQ ID NO.56所示;
ABCA8基因:正向引物如SEQ ID NO.57所示,反向引物如SEQ ID NO.58所示;
FOSB基因:正向引物如SEQ ID NO.59所示,反向引物如SEQ ID NO.60所示;
MAOB基因:正向引物如SEQ ID NO.61所示,反向引物如SEQ ID NO.62所示;
STAP1基因:正向引物如SEQ ID NO.63所示,反向引物如SEQ ID NO.64所示;
TFPI2基因:正向引物如SEQ ID NO.65所示,反向引物如SEQ ID NO.66所示;
AKR1C2基因:正向引物如SEQ ID NO.67所示,反向引物如SEQ ID NO.68所示;
IGFBP6基因:正向引物如SEQ ID NO.69所示,反向引物如SEQ ID NO.70所示;
VCAN基因:正向引物如SEQ ID NO.71所示,反向引物如SEQ ID NO.72所示;
FLRT3基因:正向引物如SEQ ID NO.73所示,反向引物如SEQ ID NO.74所示;
MMP7基因:正向引物如SEQ ID NO.75所示,反向引物如SEQ ID NO.76所示;
GSTA1基因:正向引物如SEQ ID NO.77所示,反向引物如SEQ ID NO.78所示;
CRYAB基因:正向引物如SEQ ID NO.79所示,反向引物如SEQ ID NO.80所示;
PAH基因:正向引物如SEQ ID NO.81所示,反向引物如SEQ ID NO.82所示;
IGFBP1基因:正向引物如SEQ ID NO.83所示,反向引物如SEQ ID NO.84所示;
ATP6V0A4基因:正向引物如SEQ ID NO.85所示,反向引物如SEQ ID NO.86所示;
ALDOB基因:正向引物如SEQ ID NO.87所示,反向引物如SEQ ID NO.88所示。
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