[发明专利]鉴别长毛对虾幼体和墨吉对虾幼体的分子标记引物及方法在审
申请号: | 201711273848.1 | 申请日: | 2017-12-06 |
公开(公告)号: | CN108070663A | 公开(公告)日: | 2018-05-25 |
发明(设计)人: | 单斌斌;孙典荣;刘岩;杨长平;刘胜男;李腾 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院南海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人: | 陈娟 |
地址: | 510300 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 对虾幼体 墨吉对虾 分子标记引物 鉴别 分子标记序列 测序 扩增 样本群体 基因组 样本群 引入 比对 | ||
1.鉴别长毛对虾幼体和墨吉对虾幼体的分子标记引物,其特征在于包括引物一和引物二:
引物一:16SF1:TTCAATCTACCTTTCAGT;
引物二:16SR1:TTTATCCTGGCTTATTCT。
2.用于权利要求1所述的鉴别长毛对虾幼体和墨吉对虾幼体的分子标记引物的方法,包括如下步骤:
1)选取长毛对虾幼体和墨吉对虾幼体,组成长毛对虾幼体和墨吉对虾幼体样本群,分别提取2个样本群体的DNA;
2)以步骤1)中的基因组DNA为模板,设计PCR反应体系分别进行扩增,得到长毛对虾幼体分子标记序列和墨吉对虾幼体分子标记序列;
3)对扩增产物进行纯化、测序,比对测序结果,鉴别其种类。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,在步骤2)中,所述PCR反应体系组成为:超纯水17.5ul,10×buffer 2.5ul,dNTPs 2ul,rTaq 0.15ul,DNA模板1ul,Primer各1ul。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,在步骤2)中,PCR扩增程序为:94℃预变性5min,然后94℃变性35sec,50℃退火35sec,72℃延伸35sec,进行38个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,
所述长毛对虾幼体分子标记序列为:
ATAACCGCGGCTGCTGGCACAAATTTTAGCCAGATATTTAATTAGGATCATCAATTCCAACTTACATTTATCTAATTAGTACTAGGTACTGAGAATTTATTTCTTAACGAAACCTCTTCCTTTAATTAATTCATTAACCTTTAGTATCTTTAACAATGAATCTTATTGTCACAATAAATTTTACATGTACCGTTGACCTAAAAATGAA。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,
所述墨吉对虾幼体分子标记序列为:
ATAACCGCGGCTGCTGGCACAAATTTTAGCCAGATATATAATTAGGATCATCAATTCCAACTTACATTTATCTAATTAGTACTAGGTACTGAGAATTTATTTCTTAATGAAACCTCTCCCTTTAACTGATTCACTAACCTTTAGTATCCTTAATAATGAATCTTATTGTCACAATAAATTTTACATGTACCATTAACCTAAAAATGAA。
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