[发明专利]一种烟曲霉唑类耐药的分子生物学快速检测方法在审
申请号: | 201711276495.0 | 申请日: | 2017-12-06 |
公开(公告)号: | CN109880892A | 公开(公告)日: | 2019-06-14 |
发明(设计)人: | 刘沐桑;刘维达;郑海林;梁官钊 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院皮肤病医院 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/686;C12Q1/04 |
代理公司: | 南京天翼专利代理有限责任公司 32112 | 代理人: | 李建芳 |
地址: | 210042 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 烟曲霉 分子生物学 快速检测 真菌 唑类 扩增 提取试剂盒 临床标本 微量DNA 真菌DNA 突变型 核酸 测序 位点 突变 耗时 采集 标本 检测 优化 | ||
本发明公开了一种烟曲霉唑类耐药的分子生物学快速检测方法,采集临床标本,用真菌微量DNA提取试剂盒提取真菌DNA,使用真菌ITS特异引文进行扩增,将扩增结果进行测序,blast确定标本中真菌种类,如果有烟曲霉,优化TaqMan探针,使用realtime PCR技术检测L98H突变型对应的核酸位点DNA第363‑365bp有无突变。本发明烟曲霉唑类耐药的分子生物学快速检测方法,具有耗时短,敏感性好,准确性高等优势。
技术领域
本发明涉及一种烟曲霉唑类耐药的分子生物学快速检测方法,属于耐药监测领域。
背景技术
曲霉是最常见的环境真菌,多感染免疫缺陷人群引起肺、鼻窦和脑曲霉病,治疗困难且病死率高。一项北美对960例侵袭性曲霉病的研究发现,主要为血液肿瘤、器官移植和造血干细胞移植患者并发肺部感染,12周内病死率高达45.6%。我国的数据提示侵袭性曲霉病在血液干细胞移植患者发病率10.8%而病死率60%,肝移植患者发病率4.8%而病死率62.5%,并且侵袭性曲霉病的发病率在逐年增加。
侵袭曲霉病绝大多数由烟曲霉引起,在欧洲达到95%以上。自1997年美国报道了首例伊曲康唑耐药以来,烟曲霉耐药逐渐增加,中国孙毅等也陆续报道了烟曲霉伊曲康唑耐药和联合耐药。英国研究发现烟曲霉唑类耐药比率1997-1998年为0%,2004-2005年为5%,2007年为17%,2008年为14%,2009年为20%,其中2008-2009年78%耐药株为多重耐药。
唑类药物使真菌病治疗有了革命性的突破,不仅仅因为抗菌谱广,还因为相对于两性霉素B药物毒性明显降低。2008年美国感染性疾病协会发表的曲霉病治疗方案中,肺、鼻窦和脑等侵袭性曲霉病首选伏立康唑,其次为两性霉素B及其脂质体、卡泊芬净、泊沙康唑和伊曲康唑。伊曲康唑、伏立康唑和泊沙康唑可口服,故慢性或过敏性曲霉病首选。因此,烟曲霉唑类耐药的临床危害很大,且有逐渐增加的趋势,需要密切关注和积极研究。
国内外的真菌耐药检测还是以传统真菌培养和药敏实验为主,耗时长,敏感性差。
发明内容
为了解决现有技术中存在的上述缺陷,本发明提供一种烟曲霉唑类耐药的分子生物学快速检测方法。
为解决上述技术问题,本发明所采用的技术方案如下:
一种烟曲霉唑类耐药的分子生物学快速检测方法,采集临床标本,用真菌微量DNA提取试剂盒提取真菌DNA,使用真菌ITS特异引文进行扩增,将扩增结果进行测序,blast确定标本中真菌种类,如果有烟曲霉,优化TaqMan探针,使用realtime PCR技术检测L98H突变型对应的核酸位点DNA第363-365bp有无突变。
为了提高检测准确性,优选,步骤1)中,真菌微量DNA提取试剂盒为Qiagen真菌微量DNA提取试剂盒。
设计特异性引物,对我国临床最为常见的烟曲霉唑类耐药突变TR34/L98H和
TR34/L98H/S297T/F495I进行快速的分子生物学检测。由于我国cyp51A基因突变尤其以L98H型突变最为常见,该突变导致高度的伊曲康唑MIC>16mg/L)、伏立康唑和泊沙康唑耐药。L98H突变型对应的核酸位点为DNA第363-365bp,是一个SNIP位点,可以有2种以上的基因型。
本发明未提及的技术均参照现有技术。
本发明烟曲霉唑类耐药的分子生物学快速检测方法,具有耗时短,敏感性好,准确性高等优势。
附图说明
图1为现有技术及本申请检测方法对照示意图。
具体实施方式
为了更好地理解本发明,下面结合实施例进一步阐明本发明的内容,但本发明的内容不仅仅局限于下面的实施例。
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