[发明专利]粉棒束孢特异性检测试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201711286686.5 | 申请日: | 2017-12-07 |
公开(公告)号: | CN107974511B | 公开(公告)日: | 2020-06-02 |
发明(设计)人: | 秦少容;李春峰;卿玉玲;陈仕江;陈若霓;鲁增辉;仝超群 | 申请(专利权)人: | 重庆太极医药研究院有限公司;西南大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 | 代理人: | 赵荣之 |
地址: | 408000*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 粉棒束孢 特异性 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.粉棒束孢特异性检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括Tar-1F/Tar-1R引物对,所述Tar-1F/Tar-1R引物对序列如SEQ ID NO.41和SEQ ID NO.42所示。
2.根据权利要求1所述粉棒束孢特异性检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括ITS5-172/ITS4-95引物对,所述ITS5-172/ITS4-95引物对序列如SEQ ID NO.43和SEQ IDNO.44所示。
3.根据权利要求1或2所述粉棒束孢特异性检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括DNA聚合酶和ddH2O。
4.利用权利要求1~3任一项所述试剂盒检测土壤样本中粉棒束孢污染的方法,其特征在于:包括如下步骤:
(1)提取土壤样品中总核酸;
(2)以步骤(1)提取的总核酸为模板,SEQ ID NO.41和SEQ ID NO.42所示序列为引物进行PCR扩增,若结果为阳性,再将提取的总核酸用SEQ ID NO.43和SEQ ID NO.44所示序列为引物进行PCR扩增,扩增结果为阳性表明样本中含有粉棒束孢。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤(1)中,提取土壤样品中总核酸方法如下:
1)取土壤样品,加石英砂充分研磨;
2)向研磨样品中加入清洗液,震荡,离心,收集沉淀;重复2次,再加入PBS缓冲液洗涤;所述清洗液各组分浓度如下:6 g/L三羟甲基氨基甲烷,5.8 g/L EDTA,5.8 g/L NaCl,10g/L交联聚维酮,pH=8.5;
3)向经步骤2)处理的样品中加入裂解液,溶菌酶,蛋白酶K,振荡,充分裂解,离心,收集上清;所述裂解液各组分浓度如下:100mmol pH=8.0的Tris-HCl,100mmol pH=8.0的EDTA,100mmol Na3PO4,1.5mol NaCl,50g 聚乙烯吡咯烷酮,10g CTAB,pH=8.0,加水定容至1L;
4)加入与上清液等体积的酚/氯仿/异戊醇,混匀,离心收集上清;
5)加入相当于上清液0.1倍体积的浓度为3 mol/L的 NaAc,再加入相当于上清液0.6倍体积的异丙醇,4℃沉淀,离心,用体积分数70%的乙醇洗涤,离心,沉淀晾干,最后用水溶解即可。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤(1)中,提取土壤样品中总核酸方法如下:
1)取土壤样品,加石英砂充分研磨;
2)向研磨样品中按重量体积比为0.5:3,单位g/ ml,加入清洗液,震荡5min,18~25℃、12000 rpm离心5 min,收集沉淀,重复2次,加入与清洗液等体积的 PBS缓冲液,洗涤一次;
3)向经步骤2)处理的样品中按清洗液:裂解液:溶菌酶:蛋白酶K体积比为3:5:0.5:0.015分别加入裂解液,浓度为20 mg/mL的溶菌酶和浓度为20 mg/mL的蛋白酶K,振荡10min,37℃水浴30 min,8000 rpm离心10 min,收集上清;
4)上清中加入与上清液等体积的酚/氯仿/异戊醇,颠倒混匀,18~25℃、12000 rpm离心10 min,收集上清;
5)向步骤4)所得上清中加入相当于上清液0.1倍体积的浓度为3 mol/L的 NaAc,再加入相当于上清液体积0.6倍体积的异丙醇,4℃沉淀1 h,12000 rpm离心10 min,用体积分数为70%的乙醇洗涤,12000 rpm离心10 min,晾干,最后用水溶解。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,所述PCR扩增条件如下:98℃预变性2min;98℃变性10s,55℃退火15s,72℃延伸30s,35个循环;72℃延伸5min,最后16℃保存。
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