[发明专利]多糖多酚植物基因组DNA提取CTAB方法的技术改进在审

专利信息
申请号: 201711343588.0 申请日: 2017-12-07
公开(公告)号: CN109897849A 公开(公告)日: 2019-06-18
发明(设计)人: 不公告发明人 申请(专利权)人: 中禾生物种业集团有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 518040 广东省深圳市福*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 多酚 聚乙烯吡咯烷酮PVP 植物组织DNA 碱性氧化铝 柱子 氯化钙溶液浸泡 植物基因组DNA 沉淀洗涤 技术改进 乙醇溶液 植物组织 多酚类 浸洗 去除 浸泡 沉淀 改进
【说明书】:

发明实现了一种多糖多酚类植物中DNA提取的方法改进。这种改进方法,在提取多糖多酚植物组织DNA的时候,会首先使用含有聚乙烯吡咯烷酮PVP K‑90的CTAB缓冲液浸泡多糖多酚的植物组织,然后在植物组织DNA通过碱性氧化铝的柱子的时候,先利用氯化钙溶液浸泡碱性氧化铝柱子,最后一步沉淀洗涤的时候,再用含有聚乙烯吡咯烷酮PVP K‑90的乙醇溶液沉淀浸洗提取的DNA,去除其它杂质。通过这些处理步骤提高了利用CTAB方法在多糖多酚植物中DNA提取的浓度和效率。

技术领域

本发明涉及到一种CTAB的DNA提取方法,尤其是在多糖多酚植物中怎么样改善DNA提取效率的方法

背景技术

提取DNA是很多分子生物学实验技术的基础,是很多有关分子生物学实验的基础,怎么样能够高效率从样品中提取DNA,一直是分子生物学技术人员非常关心的话题。

CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。大体上CTAB方法提取植物DNA的整个过程是,先采用机械破碎植物细胞,然后加入CTAB分离缓冲液将DNA溶解出来,再经氯仿-异戊醇抽提除去蛋白质,最后得到DNA。

在提取DNA的过程中,多糖多酚类的物质会严重的阻扰DNA的提取。该类多糖多酚类物质主要是植物体内的复杂酚类次生代谢物,具有多元酚结构,主要存在于植物的皮、根、叶、果中。在植物中的含量仅次于纤维素。酚类是植物特有的一种次生代谢产物,是非常容易被氧化成为褐色的醌类次生代谢产物。某些植物和植物的某些特异组织含有较高量的酚类物质。植物多糖,又称植物多聚糖,是植物细胞代谢产生的聚合度超过10个的聚糖。而糖类也是植物次生代谢的重要产物,由于核酸都是由多糖类物质构成,提取的多糖成分经常混合在DNA提取的终产物的过程中,干扰核酸的提取纯化。

在提取DNA的过程中,多糖多酚类物质会结合到DNA中,有的甚至形成不可逆的结合,并且难以去除,严重影响了DNA的浓度。而在一些植物中,多糖多酚类物质的含量高,在针对这些植物基因组DNA的提取过程中,传统DNA提取方法多糖多酚类物质会一直存续在溶液中,妨碍了DNA提取质量和纯度的提高。

传统的CTAB提取方法所需要提供的其它各种试剂和作用:Tris-HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl提供一个高盐环境,使DNA充分溶解,存在于液相中;β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除。

本实验室在传统的CTAB的DNA提取方法再进行了一些改进。通过比对传统的DNA提取方法,依据我们这些改进的方法,能够较高效的在植物基因组中进行多糖多酚类植物组织材料的DNA提取,对下一步的分子生物学实验非常有帮助。

发明内容

目的是为了提取多糖多酚植物中基因组DNA,通过改进方法和步骤能够高效的通过CTAB方法,获取植物的基因组DNA结果

附图说明

为了测定改进后DNA的提取效果,利用超微量分光光度计进行核酸浓度和纯度的检测。举例提取的基因组DNA为玉米,西瓜,葡萄,苹果多糖多酚植物基因组DNA。此样品含有大量的多糖多酚,会经常干扰 DNA的提取效果。

在超微量分光光度计中测定核酸浓度和比值,得到结果如表。在0.8%的琼脂糖凝胶EB电泳中加入通过传统CTAB方法和改进CTAB方法纯化得到的基因组DNA进行比对电泳,同时点加利用此方法纯化DNA所得到的PCR扩增内参片段的DNA电泳样进行分析判断,结果如图。

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