[发明专利]一种基于rs80995809位点基因分型鉴定猪背膘厚的方法及其应用

说明书

本发明公开了一种基于rs80995809位点基因分型鉴定猪背膘厚的方法及其应用。本发明的方法是检测猪个体rs80995809位点的基因型是GG基因型、TT基因型还是GT基因型，根据猪个体的基因型确定猪个体的背膘厚大小：GG基因型的猪个体的背膘厚大于GT基因型的猪个体的背膘厚，GT基因型的猪个体的背膘厚大于TT基因型的猪个体的背膘厚。通过实验证明：rs80995809位点对猪活体背膘厚有显著影响，筛选出来的SNP可作为分子遗传标记，寻找与其相关或紧密连锁的影响背膘厚数数量性状基因座，以对大白猪直接进行基因型选择或标记辅助选择，从而加快大白猪优势品种的选育。

技术领域

本发明属于基因工程领域，具体涉及一种基于rs80995809位点基因分型鉴定猪背膘厚的方法及其应用。

背景技术

猪为六畜之首，养猪业在世界尤其是在中国国民经济中占有重要地位。猪肉在诸多肉类产品中的比重一直保持在三分之一左右，是人们比较喜爱的肉食之一。随着人们的生活不断改善和现代育种技术的发展，传统的选育手段已经不能满足人们对猪肉品质的需求，培育出生产性能高，肉质健康、风味优良的种猪就显得格外重要。

背膘厚是猪的重要胴体性状之一，反映了猪肉脂肪含量的高低。背膘厚数值低表示猪肉的脂肪含量少，瘦肉率高，反之表示猪肉的脂肪含量多，瘦肉率低。在猪生产中，背膘厚度主要由遗传因素决定，此外，也可以通过营养调控和控制采食量来控制。背膘厚度最直接体现猪的肉质品质，是重要的经济性状，且对于母猪的繁殖性能也有影响。

分子标记(Molecular Markers)是指应用大分子化合物、蛋白质和DNA在生物个体间的差异来标识遗传变异的技术方法。DNA分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接反映。与其他几种遗传标记——形态学标记、生物化学标记、细胞学标记相比，DNA分子标记具有其优越性：多数为共显性，对隐性的性状的选择十分便利；基因组变异丰富，标记的数量多；检测手段简单、迅速。随着分子生物学技术的发展，DNA分子标记技术已有数十种，广泛应用于遗传连锁图的构建和基因定位、遗传育种、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。

SNP(Single Nucleotide Polymorphism，单核苷酸多态性)，是指在基因组上单个核苷酸的变异形成的DNA序列上的多态性。理论上讲，基因组DNA上任何一个核苷酸都有四种可能的碱基组成形式，但大多数情况下只有两种碱基的变异，由一个碱基发生转换(Transitions)或颠换(Transversion)而变成另一个碱基，通常转换发生的频率要高于颠换，所以SNP标记通常为双等位基因(Vigna等，A review on SNP and other types ofmolecular markers and their use in animal genetics.Genet SelEvol.2002,34:275-306.)。SNP标记数量多，在基因组上分布广。基于SNP的新型高通量分子标记技术主要有两大类：一类是基于新一代测序技术的高通量分子标记技术；另一类是基于基因芯片技术的分子标记技术。

随着我国种猪核心群生产性能的变化，对达100Kg体重活体背膘厚的计算也需要进行相应调整，全国猪联合育种协作组专家经过3年的测试，收集了大量数据，研发了新的100Kg体重活体背膘厚校正公式，计算方法为猪只在85-130Kg范围称重，同时用B超测定倒数第3-4肋间、距背中线5cm处的背膘厚(以毫米为单位)，然后按照如下公式计算100Kg体重活体校正背膘厚(不同品种的B值不同)：目标体重背膘厚＝实际背膘厚+(目标体重-实际体重)×实际背膘厚/(实际体重-B)，此校正公式，对推动我国种猪测定和遗传评估起到积极作用。近十年来分子生物技术的发展为猪育种提供了一种基于SNP基因型的辅助选择方法，为显著改善猪肉质品质提供可能。

发明内容

本发明的第一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定猪背膘厚性状的方法。