[发明专利]一种水稻PTC1基因缺失突变体及其分子鉴定方法和应用在审
| 申请号： | 201711365193.0 | 申请日： | 2017-12-18 |
| 公开（公告）号： | CN108243963A | 公开（公告）日： | 2018-07-06 |
| 发明（设计）人： | 黄培劲;龙湍;李京琳;李新鹏;曾翔;吴永忠 | 申请（专利权）人： | 海南波莲水稻基因科技有限公司 |
| 主分类号： | A01H5/00 | 分类号： | A01H5/00;A01H6/46;C12N15/11;C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君;陈征 |
| 地址： | 570125 海南省海*** | 国省代码： | 海南;46 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 突变体 基因缺失突变体 隐性雄性核不育 核苷酸序列 缺失片段 位碱基 水稻 育种 应用 分子标记鉴定 水稻种质资源 水稻基因组 转基因水稻 分子标记 分子鉴定 碱基缺失 缺失基因 遗传改良 钴60辐射 籼稻品种 染色体 可用 位点 诱变 制种 制备 基因 | ||
1.一种水稻PTC1基因缺失突变体ptc1-1664，其为水稻基因组版本ASM465v1第9染色体上，从第15324556位碱基开始到第15583926位碱基共259370个碱基缺失，该缺失片段包含整个PTC1基因。
2.如权利要求1所述水稻PTC1基因缺失突变体ptc1-1664，其缺失片段两端侧翼核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
3.权利要求1或2所述的水稻PTC1基因缺失突变体ptc1-1664在制备转基因植物中的应用。
4.权利要求1或2所述的水稻PTC1基因缺失突变体ptc1-1664在制备隐性雄性核不育的转基因水稻中的应用。
5.权利要求1或2所述的水稻PTC1基因缺失突变体ptc1-1664在水稻改良育种、制种中的应用。
6.检测权利要求1或2所述的水稻PTC1基因缺失突变体ptc1-1664的分子标记，其特征在于，该分子标记是由以下引物组合扩增得到，所述引物组合含有3条引物，其核苷酸序列分别为：
上游引物1664_F1：CATCTCGCAGTTTACATGCAG，
下游引物1664_R1：AGTCTACTCGAGCTACTACCG，
下游引物1664_R2：CCATCTGAAACTAGTACTCCCA。
7.权利要求6所述的分子标记在制备隐性雄性核不育的转基因水稻中的应用。
8.检测权利要求1或2所述的水稻PTC1基因缺失突变体ptc1-1664的方法，其特征在于，通过下述引物组合扩增待检植物基因组DNA，并检测扩增产物：
所述引物组合的核苷酸序列为：
上游引物1664_F1：CATCTCGCAGTTTACATGCAG，
下游引物1664_R1：AGTCTACTCGAGCTACTACCG，
下游引物1664_R2：CCATCTGAAACTAGTACTCCCA，
如果用上述引物组合扩增出的产物为811bp，则标志着该待检植物PTC1基因型为野生型；如果扩增产物为546bp，则标志着该待检植物PTC1基因型为ptc1-1664突变体；如果扩增产物为546bp、811bp两条带型，则标志着该待检植物PTC1基因型为野生型和ptc1-1664突变体的杂合基因型。
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