[发明专利]用于检测叶酸代谢相关基因SNP的引物、荧光探针及应用在审
申请号: | 201711370372.3 | 申请日: | 2017-12-19 |
公开(公告)号: | CN108034710A | 公开(公告)日: | 2018-05-15 |
发明(设计)人: | 汪元涛;朱月艳;孙子奎 | 申请(专利权)人: | 上海派森诺医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人: | 吕伴 |
地址: | 201799 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 叶酸 代谢 相关 基因 snp 引物 荧光 探针 应用 | ||
1.一组用于检测叶酸代谢相关基因SNP的第一引物:其特征在于,所述第一引物为如下引物对:
677-F:CTGACCTGAAGCACTTGAAGGAGAA;
677-R:GGGACGATGGGGCAAGTGA;
由正向引物677-F:CTGACCTGAAGCACTTGAAGGAGAA或反向引物677-R:
GGGACGATGGGGCAAGTGA的核苷酸序列经增加、缺失或替换单个核苷酸得到的引物;
上述第一引物所对应的目的基因均为亚甲基四氢叶酸还原酶基因,以该基因为模板扩增所得DNA片段包含rs1801133[MTHFR(C677T)]位点。
2.一种与权利要求1所述的用于检测叶酸代谢相关基因SNP的第一引物配合使用的第一荧光探针,其特征在于,所述第一荧光探针包含如下两条:
W677:FAM-ATGAAATCGGCTCCCGC-MGB;
M677:VIC-ATGAAATCGACTCCCGC-MGB。
3.权利要求1所述的第一引物和/或权利要求2所述第一荧光探针在制备检测亚甲基四氢叶酸还原酶基因rs1801133[MTHFR(C677T)]多态性的试剂盒中的应用。
4.用于检测叶酸代谢相关基因SNP的第二引物:其特征在于,所述第二引物为如下引物对:
1298-F:TGAAGAGCAAGTCCCCCAAGG;
1298-R:CCACTCCAGCATCACTCACTTTG;
由正向引物1298-F:TGAAGAGCAAGTCCCCCAAGG或反向引物1298-R:
CCACTCCAGCATCACTCACTTTG的核苷酸序列经增加、缺失或替换单个核苷酸得到的引物;
上述第二引物所对应的目的基因均为亚甲基四氢叶酸还原酶基因,以该基因为模板扩增所得DNA片段包含rs1801131[MTHFR(A1298C)]位点。
5.一种与权利要求4所述用于检测叶酸代谢相关基因SNP的第二引物配合使用的第二荧光探针,其特征在于,所述第二荧光探针包含如下两条:
W1298:FAM-CAAAGACACTTTCTTCAC-MGB;
M1298:VIC-CAAAGACACTTGCTTCAC-MGB。
6.权利要求4所述的第二引物和/或权利要求5所述第二荧光探针在制备检测亚甲基四氢叶酸还原酶基因rs1801131[MTHFR(A1298C)]多态性的试剂盒中的应用。
7.用于检测叶酸代谢相关基因SNP的第三引物:其特征在于,所述第三引物为如下引物对:
66-F:TTGAAGTGATGAGGAGGTTTCTGTT;
66-R:GATCTGCAGAAAATCCATGTACCA;
由正向引物66-F:TTGAAGTGATGAGGAGGTTTCTGTT或反向引物66-R:
GATCTGCAGAAAATCCATGTACCA的核苷酸序列经增加、缺失或替换单个核苷酸得到的引物;
上述第三引物所对应的目的基因均为甲硫氨酸合成酶还原酶,以该基因为模板扩增所得DNA片段包含rs1801394[MTRR(A66G)]位点。
8.一种与权利要求7所述用于检测叶酸代谢相关基因SNP的第三引物配合使用的第三荧光探针,其特征在于,所述第三荧光探针包含如下两条:
W66:FAM-CTCACATATTTCTTC-MGB;
M66:VIC-CTCACACATTTCTT-MGB。
9.权利要求7所述的第三引物和/或权利要求8所述第三荧光探针在本发明还提供上述第三引物和/或第三探针在制备检测甲硫氨酸合成酶还原酶rs1801394[MTRR(A66G)]多态性的试剂盒中的应用。
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