[发明专利]基于极坐标变换数据增强的淋巴类细胞分类方法及其装置有效
申请号: | 201711376577.2 | 申请日: | 2017-12-19 |
公开(公告)号: | CN107977682B | 公开(公告)日: | 2021-09-28 |
发明(设计)人: | 曹汛;洪羽萌;沈瀚;闫锋;张丽敏;华夏;夏永泉;李智洋 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G06T7/12;G06T7/136;G06T7/187 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 李媛媛 |
地址: | 210046 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 坐标 变换 数据 增强 淋巴 细胞 分类 方法 及其 装置 | ||
1.基于极坐标变换数据增强的淋巴类细胞分类方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1,获取染色血细胞的原始图像;
S2,分离原始图像的RGB通道,计算R通道与G通道的比值矩阵;
S3,根据R通道与G通道的比值绘制比值矩阵的直方图,根据阈值范围将原始图像二值化,得到淋巴细胞和异型淋巴细胞的二值图像;
S4,将二值图像进行一系列的形态学处理;
S5,用连通域的方法提取经形态学处理后的细胞图像的边缘像素点,找到细胞上下左右的边缘像素点,然后分割细胞;
S6,取细胞边缘的任一像素点为极点,建立极坐标系,将其余像素点用极坐标变换一一映射到直角坐标系中;
S7,遍历细胞的边缘像素点,以新像素点为极点再次将图像映射到直角坐标系中,因此每个边缘像素点作为极点都能产生一张变换后的图像;
S8,将步骤S7得到的变换后的图像作为神经网络的输入,训练网络,测试分类结果,分出淋巴细胞和异型淋巴细胞。
2.根据权利要求1所述的基于极坐标变换数据增强的淋巴类细胞分类方法,其特征在于,所述步骤S3中,阈值范围的确定方法具体为:淋巴类细胞属于白细胞为前景,其余细胞为背景,找到分离背景与前景的临界点为1.19,大于1.19的区域为细胞浆和细胞核,将像素值设为255;小于1.19的区域为背景区域,将像素值设为0。
3.根据权利要求1所述的基于极坐标变换数据增强的淋巴类细胞分类方法,其特征在于,所述步骤S4中,形态学处理的方法为:先对二值图像进行填充运算,填补漏洞;然后用10×10的模板进行闭运算处理,将一些颜色较深的背景细胞滤除;最后去除连通区域像素点小于1000的区域。
4.根据权利要求1所述的基于极坐标变换数据增强的淋巴类细胞分类方法,其特征在于,所述步骤S5中,连通域的方法采用8邻域连通,具体为:
(1)首先从上往下、从左往右对图像进行扫描,找到连通区域的第一个目标段,标记该段并且压入堆栈,作为“区域增长”的种子段;
(2)检查当前段的上下两行是否有重叠且未标记的目标段;如果不存在重叠的目标段,则把当前段弹出堆栈;如果存在重叠且未标记的目标段,则标记该段并且压入堆栈,作为新的“种子段”;本行目标段(Xs1,Xe1)和上下两行目标段(Xs2,Xe2)重叠的准则是:
Xs1-1≤Xe2并且Xe1+1≥Xs2;
其中,Xs1表示本行目标段的起始坐标,Xe1表示本行目标段的结束坐标;Xs2表示上下两行目标段的起始坐标,Xe2表示上下两行目标段的结束坐标;
(3)后续操作不断从堆栈中取出种子段,重复步骤(2)直到堆栈为空,即标记完一个连通区域;
(4)接着搜索图像中下一个未标记的连通区域,重复上述步骤(1)-(3)直到图像中所有的连通区域标记完毕。
5.根据权利要求1所述的基于极坐标变换数据增强的淋巴类细胞分类方法,其特征在于,所述步骤S6中,具体实现方法为:在一张M×N大小的图像I中,取直角坐标系中细胞边缘的任一像素点(m,n)为极点,建立极坐标系,其中M、N为像素点个数;用M条射线将2π划分成M个角度,单位角度为2π/M;那么在极坐标射线上的每个像素都可以用直角坐标表示为(m+x,n+y),也可以用极坐标表示为(θu,v),其中,v表示极坐标系中像素点的极径,θu表示极坐标系中像素点的极角:
x=v·cos(θu)
y=v·sin(θu)
设变换后的图像为如果满足条件0≤m+x<M且0≤n+y<N,即确保点(m+x,n+y)落在图像I内,则
即可得到变换后的图像作为数据增强的结果。
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