[发明专利]一种与棉花黄萎病抗性有关的QTL/主效基因的分子标记

说明书

本发明公开了一种与棉花黄萎病抗性QTL/主效基因位点qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5连锁的SSR标记，qDI‑5‑1、qDI‑5‑2、qDI‑5‑3、qDI‑5‑4、qDI‑5‑5都位于染色体C5上。利用本发明与棉花黄萎病抗性主效基因位点连锁的SSR标记进行辅助选择可提高棉花黄萎病抗性育种效率。

母案第一次审查意见通知书中，审查员指出母案存在多项发明，不具备单一性，因此申请人决定对母案中未获得保护的发明进行分案申请。本申请为申请号201410506198.0(发明名称：与棉花黄萎病抗性有关的QTL/主效基因的分子标记)的分案申请。

技术领域

本发明属于生物技术应用领域，涉及到一种来自与高抗黄萎病海岛棉海1的黄萎病抗性QTL/主效基因连锁的SSR(Simple Sequence Repeat，简单重复序列)分子标记，可用于棉花黄萎病抗性的分子标记辅助选择，以提高选择的效率，加快育种步伐。

背景技术

棉花是一种重要的经济作物，提供了世界上大多数的天然纤维。我国是世界上最大的棉花生产和消费国之一，棉花生产在整个国家经济中具有重要的战略地位。选育并种植高产、优质和抗病的棉花品种十分重要。黄萎病是棉花生产中的主要病害之一，分布于世界各主要产棉国家，是造成棉花减产的主要原因，成为世界上威胁棉花生产的灾害性病害。近年来，该病在我国3大棉区连续流行危害，且有逐加重的趋势，对棉花生产造成极大危害(简桂良等，2003)。实践证明，种植抗黄萎病品种是控制该病的根本最有效的方法。但是，我国目前棉花品种的抗性只能到抗至耐病水平(简桂良等，2004；王红梅等，2008)，因此抗萎病仍然是棉花品种选育的重要目标。

海岛棉虽然产量偏低，但大多数高抗黄萎病，而陆地棉产量高，适应性广，但缺乏优异的抗病种质系和亲本材料(肖松华等，2007)。因此挖掘海岛棉的优异抗病基因，把海岛棉优异抗病基因转移到陆地棉背景中，对我国陆地棉抗病育种具有重要的意义。

由于传统育种的整个过程中的选择主要是表型选择，而且表型性状易受环境等外在条件的影响，致使传统育种依据表型选择周期长、成本高、准确性差、选择效率低。近年来，生物技术的发展为作物性状改良提供了新的途径，通过转基因或分子标记辅助选择技术，可以从分子水平上操作目标基因，实现对目标性状的改良(杜春芳等，2005)。大量研究表明在育种过程中借助于分子标记技术手段进行辅助选择，可以有效地提高抗病品种的选育效率，进而加快育种进程。

目前，在棉花中利用分子标记技术已经构建了多张遗传图谱(Shappley etal.1998；Ulloa et al.2002；Ma et al.2008；Zhang et al.2005and 2009；Lin etal.2009；Sun et al.2012；Reinisch et al.1994；Rong et al.2004；Kohel et al.2001；Guo et al.2007；Lacape et al.2009；Park et al.2005；Xiao et al.2009；Yu etal.2011；He et al.2007；Yu et al，2007；Zhang et al，2008；Yu et al.2012；Zhao etal.2012)，定位了大量棉花纤维品质和产量的QTL。在棉花抗黄萎病基因/QTL的定位方面，陆续已有报道(Zhang et al.，2014；Zhao et al.，2014；Fang et al.，2013，2014；Ning etal.，2013；蒋锋等，2009；Yang et al.，2008；杨昶等，2007；葛海燕等，2008；王芙蓉等，2007；房卫平等，2001；高玉千等，2003；杜威世等，2004；Bolek et al.，2005；王红梅等，2005；Wang et al.，2008；甄瑞等，2006)，共计100多个与黄萎病抗性有关的QTL。这些研究为抗病育种提供了有用的信息，但是现有遗传图谱构建的饱和程度不高，生产实践可利用的标记不多，而且QTL的定位多数采用的是F₂世代群体，主要集中在单一世代或单个环境的检测，多环境稳定的QTL少。

发明内容