[发明专利]用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的引物对、试剂盒及方法在审
申请号: | 201711487648.6 | 申请日: | 2017-12-29 |
公开(公告)号: | CN107904313A | 公开(公告)日: | 2018-04-13 |
发明(设计)人: | 韩林志;肖芳;许丽媛 | 申请(专利权)人: | 韩林志 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 410154 湖南省长沙市开福区沙坪街道中*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 胃癌 相关 基因 reprimo rnf180 甲基化 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的引物对,其特征在于,包括针对Reprimo基因与RNF180基因的启动子区以及β-Actin内参基因的特异性引物及探针,如下:
Reprimo正向引物:5'-TGCGAGTGAGCGTTTAGTTC-3',
Reprimo反向引物:5'-TCCGTCTAATTACCTAAAACCGA-3',
Reprimo检测探针:5'-AACGAACGAACGCCGCGAACGAC-3';
RNF180正向引物:5'-TGCGGGGTTTGGTTTTTGT-3',
RNF180反向引物:5'-AAAACCTCCAACTTCACACCC-3',
RNF180检测探针:5'-CGTCGTCGGAGTCGTAGCGAGTTT-3';
其中,所述Reprimo检测探针及RNF180检测探针的5'端分别使用FAM,VIC标记作为发光基团,3'端均使用BHQ1作为淬灭基团;
β-Actin正向引物:5'-ATTTGAGATGTATGAAGGTTTTTGG-3',
β-Actin反向引物:5'-ACACCACAAAATCACACTTAACCT-3',
β-Actin检测探针:5'-AAACCCTAACTACCTCCACCCACTCCCA-3';
其中,所述β-Actin检测探针的5'端使用ROX标记作为发光基团,3'端使用BHQ2作为淬灭基团。
2.一种用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的试剂盒,其特征在于,包括含有如权利要求1所述的特异性引物及探针的PCR反应液,所述PCR反应液包括:Reprimo正向引物、Reprimo反向引物及Reprimo检测探针,RNF180正向引物、RNF180反向引物及RNF180检测探针,β-Actin正向引物、β-Actin反向引物及β-Actin检测探针,10×PCR buffer,dNTP、Mg2+及无核酸酶水。
3.根据权利要求2所述的用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Ex Taq酶。
4.根据权利要求2所述的用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应液的成分终浓度为:1×PCR buffer,0.4μM Reprimo正向引物、0.4μM Reprimo反向引物、0.2μM Reprimo检测探针,0.4μM RNF180正向引物、0.4μM RNF180反向引物、0.2μM RNF180检测探针,0.4μM β-Actin正向引物、0.4μM β-Actin反向引物、0.2μM β-Actin检测探针,4.0mM dNTP,4.0mM Mg2+。
5.根据权利要求2-4中任一所述的用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的试剂盒,其特征在于,还包括阳性对照品及阴性对照品,所述阳性对照品分别为Reprimo甲基化标准品DNA及RNF180甲基化标准品DNA,所述阴性对照品为非甲基化标准品DNA。
6.一种用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一:取待检测样本抽提的DNA,对其进行转化处理,转化后的DNA作为PCR的模板;
步骤二:提供如权利要求5所述的试剂盒,对所述模板进行PCR扩增;
步骤三:结果分析,检测结果满足质控要求,即待检测样本β-actin的检测Ct值≤33时根据检测结果对样本进行判断;根据样本检测结果Reprimo基因Ct值与Reprimo预先设定Ct值的差别,判断待检测样本Reprimo基因甲基化检测是否为阳性;根据样本检测结果RNF180基因Ct值与RNF180预先设定Ct值的差别,判断样本RNF180基因甲基化检测是否为阳性。
7.根据权利要求6所述的用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的方法,其特征在于,所述步骤一中转化处理所采用的试剂为亚硫酸氢盐或重亚硫酸盐。
8.根据权利要求7所述的用于胃癌相关基因Reprimo、RNF180甲基化检测的方法,其特征在于,所述步骤二中PCR扩增反应程序为:50℃ 2min;95℃变性5min;45cycles,95℃ 15sec,55℃ 45sec。
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