[发明专利]多项扩增法在审
申请号: | 201780017193.3 | 申请日: | 2017-04-19 |
公开(公告)号: | CN108779453A | 公开(公告)日: | 2018-11-09 |
发明(设计)人: | 山口正裕;蔵田信也 | 申请(专利权)人: | 日铁住金环境株式会社 |
主分类号: | C12N15/09 | 分类号: | C12N15/09;C12Q1/6844 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 曹阳 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 人工核酸 末端侧 反向引物 正向引物 目标核酸 引物 序列A 多个基因 方法使用 引物对组 上游 测序仪 引物组 有效地 扩增 | ||
1.一种方法,该方法使用由包含至少1对以上的包含正向引物(a)和反向引物(b)的引物对的引物对组X、包含正向引物(c)和反向引物(d)的引物对Y、以及包含正向引物(e)和反向引物(f)的引物对Z构成的引物组,同时地扩增多个目标核酸组,
所述正向引物(a)在3’末端侧具有与目标核酸互补的序列,在其上游侧具有人工核酸序列A的全部或3’末端侧的一部分序列,所述反向引物(b)在3’末端侧具有与目标核酸互补的序列,在其上游侧具有人工核酸序列B的全部或3’末端侧的一部分序列,
所述正向引物(c)在3’末端侧具有人工核酸序列A,在5’末端侧具有人工核酸序列C,所述反向引物(d)在3’末端侧具有人工核酸序列B,在5’末端侧具有人工核酸序列D,
所述正向引物(e)具有人工核酸序列C的全部或一部分序列,所述反向引物(f)具有人工核酸序列D的全部或一部分序列。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,
所述引物对Y的正向引物(c)和反向引物(d)分别在人工核酸序列C、D的3’末端与人工核酸序列A、B的5’末端之间具有用于识别样品的人工核酸序列,即以下的条形码序列。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中,
最先将所述的引物对组X及引物对Y、Z全都混合,不进行中途的纯化、稀释地利用一连串的反应完成所述扩增。
4.根据权利要求1~3中任一项所述的方法,其中,
在试样溶液中,所述引物对Z以所述引物对Y的浓度的至少3倍存在。
5.根据权利要求1~3中任一项所述的方法,其中,
在试样溶液中,所述引物对Y以不产生来自于它的引物二聚体的浓度存在,并且所述引物对Z以足以获得目的产物的浓度存在。
6.根据权利要求1~5中任一项所述的方法,其中,
所述引物对组X包含至少5对引物。
7.根据权利要求1~6中任一项所述的方法,其中,
所述引物对组X包含至少20对引物。
8.根据权利要求1~7中任一项所述的方法,其中,
在试样溶液中,所述引物对组X中的各引物对以1nM~20nM的范围存在。
9.根据权利要求1~8中任一项所述的方法,其中,
在试样溶液中,通过调整所述引物对组X中的各引物对的浓度,可以使各目标基因的扩增效率接近均匀。
10.根据权利要求1~9中任一项所述的方法,其中,
所述扩增是PCR法、LAMP法、NASBA法、ICAN法、LCR法、滚环法SMAP法、PALSAR法的任意1种。
11.根据权利要求1~10中任一项所述的方法,其中,
进行2个循环以上的利用所述引物对组X的扩增,进行20个循环以上的利用所述引物对Y、Z的扩增。
12.根据权利要求1~11中任一项所述的方法,其中,
使用具有5’→3’外切核酸酶活性的DNA聚合酶进行所述扩增。
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