[发明专利]数字微生物学

权利要求书

1.一种用于确定样品中是否存在微生物的方法，所述方法包括：

i)将样品包封在多个油包水乳液液滴中，其中所述油包水乳液液滴还包封微生物生长培养基；

ii)在允许微生物生长的温度下培养所述多个油包水乳液液滴，并保持足以使靶微生物经历5至45的倍增时间的时段；

iii)鉴定包含靶微生物的油包水乳液液滴；和

iv)响应于鉴定至少一个油包水乳液液滴中的靶微生物，确定样品中存在靶微生物。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述靶微生物选自：细菌、酵母和霉菌，并且其中所述培养步骤进行的时段对应于：

当靶微生物是细菌时，至少约4小时且不超过约16小时；

当靶微生物是酵母时，至少约6小时且不超过约12小时；和

当靶微生物是霉菌时，至少约8小时且不超过约36小时。

3.如权利要求2所述的方法，其中所述靶微生物选自：细菌、酵母和霉菌，并且其中所述培养步骤进行的时段对应于：

当靶微生物是细菌时，至少约4小时且不超过约8小时；

当靶微生物是酵母时，至少约8小时且不超过约12小时；和

当靶微生物是霉菌时，至少约8小时且不超过约24小时。

4.一种用于确定样品中是否存在微生物的方法，所述方法包括：

i)将样品包封在多个油包水乳液液滴中，其中所述油包水乳液液滴还包封微生物生长培养基；

ii)在不培养油包水乳化液滴的情况下，鉴定包含靶微生物的油包水乳液液滴；和

iii)响应于鉴定至少一种油包水乳液液滴中的靶微生物，确定样品中存在靶微生物。

5.如前述权利要求所述的方法，其中：

所述油包水液滴还包含嵌入染料；

所述油包水液滴不包含溶解剂；和

鉴定包含靶微生物的油包水液滴包括检测所述嵌入染料。

6.如权利要求1-4中任一项所述的方法，其中：

所述油包水液滴还包含标记的蛋白；

所述油包水液滴不包含溶解剂；和

鉴定包含靶微生物的油包水液滴包括检测所述标记的蛋白。

7.如权利要求6所述的方法，其中，所述标记的蛋白选自：标记的抗体，标记的凝集素和标记的纤维蛋白原。

8.如权利要求6或7所述的方法，其中，所述油包水液滴还包含牛血清白蛋白。

9.如任意前述权利要求所述的方法，其中，所述样品是环境样品。

10.如权利要求5或6所述的方法，其中，所述样品包括来自娱乐水体的水。

11.如权利要求5或6所述的方法，其中，所述样品取自表面。

12.如权利要求5或6所述的方法，其中，所述样品是临床样品。

13.一种用于快速测定食物基质中每单位质量或体积的多种靶微生物的方法，所述方法包括：

i)使食物基质的一部分均质化，其中所述基质的一部分具有已知的质量或体积；

ii)将均质化的基质包封在多个油包水乳液液滴中，其中所述油包水乳液液滴还包封微生物生长培养基；

iii)在允许微生物生长的温度下培养所述多个油包水乳液液滴，并保持足以使靶微生物倍增5至45倍的时段；

iv)从培养的油包水乳液液滴中确定：

多个含有微生物的油包水乳液液滴，从而确定多个阳性液滴；和

多个不含微生物的油包水乳液液滴，从而确定多个阴性液滴；和

v)从阳性液滴和阴性液滴的数量确定靶微生物的总数，从而确定每单位质量或体积的食物基质的靶微生物的数量。