[发明专利]Mini-III RNA酶、改变Mini-III RNA酶切割RNA序列的特异性的方法及其用途在审
申请号: | 201780019412.1 | 申请日: | 2017-01-20 |
公开(公告)号: | CN108884450A | 公开(公告)日: | 2018-11-23 |
发明(设计)人: | J.布尼克基;K.斯克沃内克;D.格洛;M.库尔克斯卡 | 申请(专利权)人: | 生物技术创新私人有限公司 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 初明明;罗文锋 |
地址: | 波兰*** | 国省代码: | 波兰;PL |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 切割 核糖核苷酸序列 枯草芽孢杆菌 氨基酸序列 可移植 氨基酸序列片段 编码构建 编码基因 底物结构 二级结构 辅助蛋白 显示序列 底物 嵌合 突变 蛋白 细胞 | ||
1. 一种具有氨基酸序列的Mini-III RNA酶,所述氨基酸序列包含受体部分和在Mini-III RNA酶结构中分别形成α4螺旋和α5b-α6环结构的可移植的α4螺旋和可移植的α5b-α6环,
其中分别形成α4螺旋和α5b-α6环结构的片段在结构上对应于分别由SEQ ID NO:1中所示的来自枯草芽孢杆菌(
其中所述Mini-III RNA酶在dsRNA切割中显示出序列特异性,所述dsRNA切割仅依赖于底物的核糖核苷酸序列,并且不依赖于底物结构中二级结构的出现,并且不依赖于其它辅助蛋白的存在,
并且其中所述Mini-III RNA酶不是SEQ ID NO: 1的来自枯草芽孢杆菌的Mini-III蛋白,也不是具有D94R突变的SEQ ID NO: 1。
2. 根据权利要求1所述的Mini-III RNA酶,其特征在于氨基酸序列由源自一种微生物的Mini-III RNA酶的受体部分与分别源自来自不同微生物的Mini-III RNA酶的α4螺旋和/或α5b-α6环序列的插入的可移植的α4螺旋和/或可移植的α5b-α6环构成。
3. 根据权利要求1或2所述的Mini-III RNA酶,其特征在于其氨基酸序列包含
- 源自BsMiniIIIwt(SEQ ID NO: 1)、或
- 可移植的α4螺旋,其源自
具有包括SEQ ID NO: 1的46-52位氨基酸的氨基酸序列的BsMiniIIIwt、或具有包括SEQID NO: 2的氨基酸36-42的氨基酸序列的CkMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 4的氨基酸40-46的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 6的56-62位氨基酸的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 8的45-51位氨基酸的氨基酸序列的FpMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 10的氨基酸45-51的氨基酸序列的FnMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 12的43-49位氨基酸的氨基酸序列的SeMiniIIIwt、或具有包括SEQ IDNO: 14的氨基酸45-51的氨基酸序列的TmMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 16的氨基酸50-56的氨基酸序列的TtMiniIIIwt,或与其具有至少80%、优选85%、更优选90%、最优选95%同一性的氨基酸序列,和/或
- 可移植的α5b-α6环,其源自
具有包括SEQ ID NO: 1的85-98位氨基酸的氨基酸序列的BsMiniIIIwt、或具有包括SEQID NO: 2的氨基酸73-86的氨基酸序列的CkMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 4的氨基酸79-88的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 6的93-106位氨基酸的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 8的82-95位氨基酸的氨基酸序列的FpMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 10的氨基酸82-95的氨基酸序列的FnMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 12的82-95位氨基酸的氨基酸序列的SeMiniIIIwt、或具有包括SEQ IDNO: 14的氨基酸82-93的氨基酸序列的TmMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 16的氨基酸87-100的氨基酸序列的TtMiniIIIwt,或与其具有至少80%、优选85%、更优选90%、最优选95%同一性的氨基酸序列。
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