[发明专利]抗-CRISPR化合物以及使用方法有效
申请号: | 201780029516.0 | 申请日: | 2017-03-13 |
公开(公告)号: | CN109152848B | 公开(公告)日: | 2022-12-09 |
发明(设计)人: | E·J·松特海默尔;A·戴维森;K·马克斯韦尔 | 申请(专利权)人: | 马萨诸塞大学 |
主分类号: | A61K48/00 | 分类号: | A61K48/00;C12N1/20;A61K31/7088;A61P31/00 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 傅宇昌 |
地址: | 美国马*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | crispr 化合物 以及 使用方法 | ||
1.质粒,其包含核酸序列,所述核酸序列编码:i)从由下列各项组成的组中选择的II-C型抗-CRISPR(Acr)氨基酸序列的至少一部分:脑膜炎奈瑟氏球菌(Neisseriameningitidis)Acr、裸面小绢猴布拉克氏菌(Brackiella oedipodis)Acr、流感嗜血菌(Haemophilus influenzae)Acr、米氏西蒙斯氏菌(Simonsiella muelleri)Acr、茄罗尔斯通氏菌(Ralstonia solanacearum)Acr和与脑膜炎奈瑟氏球菌Cas9蛋白具有至少47%同源性的Cas9蛋白相结合的Acr;ii)抗-CRISPR-相关的转录调节物蛋白;和iii)启动子。
2.权利要求1的质粒,其中所述所编码的II-C型Acr氨基酸序列的至少一部分进一步包含加合物,其选自由下列各项组成的组:核定位序列、亲和标签、表位序列标签和DYKDDDDK肽。
3.一种组合物,其包含II-C型脑膜炎奈瑟氏球菌(Nme)Cas9蛋白,以及从由下列各项组成的组中选择的II-C型抗-CRISPR(Acr)氨基酸序列的至少一部分:脑膜炎奈瑟氏球菌Acr、裸面小绢猴布拉克氏菌Acr、流感嗜血菌Acr、米氏西蒙斯氏菌Acr、茄罗尔斯通氏菌Acr和与脑膜炎奈瑟氏球菌Cas9蛋白具有至少47%同源性的Cas9蛋白相结合的Acr。
4.权利要求3的组合物,其中所述II-C型Acr氨基酸序列进一步包含加合物,其选自由下列各项组成的组:核定位序列、亲和标签、表位序列标签和DYKDDDDK肽。
5.权利要求3的组合物,其中所述II-C型NmeCas9蛋白为II-C型dNmeCas9蛋白。
6.一种方法,其包括:
a)提供:
i)包含至少一个可疑基因的生物细胞;
ii)II-C型脑膜炎奈瑟氏球菌(Nme)Cas9/sgRNA复合物,
其中所述sgRNA能够与至少一个可疑基因的靶位点杂交,并且所述II-C型NmeCas9蛋白包含结合位点;和
iii)从由下列各项组成的组中选择的II-C型抗-CRISPR(Acr)氨基酸序列的至少一部分:脑膜炎奈瑟氏球菌Acr、裸面小绢猴布拉克氏菌Acr、流感嗜血菌Acr、米氏西蒙斯氏菌Acr、茄罗尔斯通氏菌Acr和与脑膜炎奈瑟氏球菌Cas9蛋白具有至少47%同源性的Cas9蛋白相结合的Acr,其以特异性亲和力与所述结合位点相结合;
b)使所述II-C型NmeCas9/sgRNA复合物与所述生物细胞相接触,从而使得所述II-C型NmeCas9/sgRNA复合物与所述靶位点杂交;
c)用所述II-C型NmeCas9/sgRNA复合物编辑所述可疑基因;和
d)使所述结合位点与所述II-C型抗-CRISPR氨基酸序列的所述至少一部分相接触,从而使得所述编辑被减少。
7.权利要求6的方法,其中所述II-C型NmeCas9蛋白为II-C型dNmeCas9蛋白。
8.权利要求6的方法,其中所述减少的编辑防止NmeCas9结合的至少一个脱靶事件。
9.权利要求8的方法,其中所述至少一个脱靶事件选自由下列各项组成的组:DNA切割和DNA突变。
10.权利要求8的方法,其中所述减少的编辑在细胞周期的G1期期间出现。
11.权利要求6的方法,其中所述减少的编辑防止嵌合基因型。
12.权利要求6的方法,其中所述减少的编辑抑制基因驱动。
13.权利要求6的方法,其中所述减少的编辑选自由下列各项组成的组:至少70%、75%、90%和100%。
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