[发明专利]用ERK抑制剂治疗鳞状细胞癌

权利要求书

1.一种治疗有需要的受试者中的癌症的方法，其包括向所述受试者施用有效剂量的细胞外信号调节激酶(ERK)抑制剂，所述受试者包含展现出至少一种位于染色体11q13.3-13.4处的基因的扩增和/或超表达的基因组。

2.根据权利要求1所述的方法，其包括：

(a)针对所述至少一种位于染色体11q13.3-13.4处的基因的扩增和/或超表达来筛选所述受试者；以及

(b)如果确定存在所述扩增和/或超表达，则向所述受试者施用所述ERK抑制剂。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其包括如果所述受试者展现出CCND1或ANO1的扩增和/或超表达，则向所述受试者施用所述ERK抑制剂。

4.根据权利要求1或2所述的方法，其包括如果所述受试者展现出CCND1和ANO1的扩增或超表达，则向所述受试者施用所述ERK抑制剂。

5.根据权利要求1或2所述的方法，其中通过选自以下的方法来评估所述扩增：原位杂交、Southern印迹法、免疫组织化学(IHC)、聚合酶链反应(PCR)、定量PCR(qPCR)、定量实时PCR(qRT-PCR)、比较基因组杂交、基于微阵列的比较基因组杂交和连接酶链反应(LCR)。

6.根据权利要求1或2所述的方法，其中使用来自所述受试者的核酸样品来评估所述扩增。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述核酸样品包括选自基因组DNA、cDNA、ctDNA、无细胞DNA、RNA和mRNA的核酸。

8.根据权利要求6所述的方法，其中所述核酸来自癌细胞。

9.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述超表达由以下评估：

(a)检测mRNA的水平；

(b)检测由mRNA逆转录产生的cDNA的水平；

(c)检测多肽的水平；

(d)检测无细胞DNA的水平；或者

(e)核酸扩增测定、杂交测定、测序或其组合。

10.一种评估患有癌症的受试者对ERK抑制剂治疗展现出临床有益反应的可能性的方法，所述方法包括：

(a)评估包含来自癌细胞的基因组和/或转录组物质的生物样品中的至少一种位于染色体11q13.3-13.4处的基因的拷贝数谱和/或表达谱；以及

(b)基于所述拷贝数谱和/或所述表达谱使用计算机系统计算ERK抑制剂反应性的加权概率。

11.根据权利要求10所述的方法，进一步包括如果所述加权概率对应于基线概率的至少1.5倍，则将所述受试者指定为有较高概率对所述ERK抑制剂治疗展现出临床有益反应，其中所述基线概率代表在获得(b)的所述加权概率之前，所述受试者将对所述ERK抑制剂治疗展现出临床有益反应的可能性。

12.根据权利要求1、2和10中任一项所述的方法，其中所述至少一种基因选自CCND1、CTTN、FADD、ORAOV1、ANO1、PPFIA1和SHANK2。

13.根据权利要求12所述的方法，其中所述至少一种基因为CCND1或ANO1。

14.根据权利要求1、2和10中任一项所述的方法，其中所述癌症选自鳞状细胞癌和腺癌。

15.根据权利要求14所述的方法，其中所述癌症为选自肺鳞状细胞癌、食管鳞状细胞癌、宫颈鳞状细胞癌、头颈鳞状细胞癌、膀胱鳞状细胞癌和胃鳞状细胞癌的鳞状细胞癌。