[发明专利]用于治疗涉及RDH12的病症和疾病的方法和组合物

说明书

提供了密码子优化的RDH12的核酸序列，以及含有所述密码子优化的功能性RDH12的序列的重组病毒载体诸如AAV、表达盒、前病毒质粒或其它质粒。提供了表达密码子优化的功能性RDH12的重组载体。含有这些密码子优化序列的组合物可用于治疗、延缓或停止由RDH12的缺失、缺乏或不适当表达引起的某些致盲疾病的方法中。提供了用于校正非功能性的缺陷型或不充分表达的天然RDH12的其它组合物和方法。

以引用的方式并入以电子形式提交的材料

申请人将以电子形式与此一起提交的序列表材料以引用的方式并入本文。该文件被标记为“UPN-16-7699PCT_ST25.txt”，大小为9kB，并且日期为2017年7月5日。

发明背景

位于感光细胞和RPE中的类视黄醇脱氢酶/还原酶催化视觉循环中重要的氧化还原反应。RDH12视黄醇脱氢酶12(全反式/9-顺式/11-顺式)(14q23.3-q24.1)(MIM号608830)编码在视网膜中表达的双特异性酶，其作用于反式和顺式类视黄醇底物二者。参见，例如，Thompson,DA等,2005年11月,Human Mol.Genet.,14(24):3865-3875。人RDH12中的许多突变与某些形式的严重儿童期发病的常染色体隐性视网膜营养不良(arRD)相关联。例如，该基因的缺陷是利伯先天性黑蒙(Leber congenital amaurosis)13型和视网膜色素变性53的原因。

利伯先天性黑蒙(LCA)是一种严重的视网膜营养不良，影响全世界约1/80,000的人。所述病症是常染色体隐性的，并且在出生时或出生后的头几个月内，携带者呈现出异常光感受器发育。异常导致严重的视力损害和失明。RDH12相关联的LCA是稀有形式的LCA中的一种。只有约2.7％的LCA病例是由RDH12突变引起的。

视网膜色素变性(RP)53是属于色素性视网膜病群的另一种视网膜营养不良。视网膜色素变性的特征在于在眼底检查中可见的视网膜色素沉积和视杆细胞的初级丧失，随后是视锥细胞的次级丧失。患者通常有夜视失明和中周视野丧失。随着他们病状的进展，他们失去了远周视野，并且最终也失去了中间视野。RDH12也与这种致盲疾病相关联。

目前这些致盲疾病的治疗主要是支持性的，涉及将患者转诊给用于视力受损儿童的方案，矫正屈光不正并且在可能时使用弱视辅助器，以及接受职业性/教育性疗法。受影响的患者定期接受眼科评价，并通过适当的疗法在具有残余视力的患者中检查是否存在弱视、青光眼或白内障。正在评价基因增强疗法对于某些形式的利伯先天性黑蒙(LCA)的治疗。参见，例如，美国专利号8,147,823。

本领域持续需要用于成功治疗LCA13、RP53和其它眼部疾病的新型且有效的工具和方法。

发明内容

可用于治疗眼部病症的治疗组合物和方法涉及被优化以编码功能性RDH12蛋白的新型cDNA序列，以及将所述优化的序列递送至患有眼部疾病的受试者。在一个实施方案中，此类新型序列包括能够包装在病毒载体中的质粒序列。在其它实施方案中，提供新型AAV前病毒质粒和/或重组AAV以携带优化的序列。如本文所讨论的，这些载体已经在体外和体内都表现了生物学活性。

一方面，提供了编码功能性哺乳动物、优选人的RDH12的密码子优化的cDNA序列。

另一方面，表达盒包含密码子优化的核酸序列，其编码RDH12的一个或多个功能性拷贝。在一个实施方案中，表达盒还包含编码RDH12的一个或多个功能性拷贝的密码子优化的核酸序列，所述核酸序列可操作地连接并且在指导其在宿主细胞中的表达的位于5’和3’AAV ITR序列之间的调节序列的控制下。

其它方面，提供了一种载体，其含有一种或多种本文所述的表达盒，并且提供含有载体或表达盒的宿主细胞。