[发明专利]感染的早期诊断

说明书

本发明公开了确定感染类型的方法。在一个实施方案中，所述方法包括在症状发作后不超过两天测量TRAIL和/或IP10的量。

发明领域和背景

在本发明的一些实施方案中，本发明涉及与细菌和病毒感染相关的特征和决定子(determinant)的鉴定。更具体地，发现蛋白质TRAIL在症状发作后不超过两天进行分析时是特别准确的决定子。

抗生素是世界上最常用的一类处方药物，具有250-300亿美元的全球市场。抗生素也是世界上滥用最多的药物，其中占全部药物的很大一部分(40-70％)被错误地开具处方。

一种类型的抗生素滥用是在非细菌性疾病(诸如病毒感染)的情况下施用药物，其中抗生素是无效的。例如，根据美国疾病控制与预防中心CDC的数据，在美国每年有超过6000万个错误的抗生素处方用于治疗流感。抗生素处方过量的保健和经济后果包括：(i)全球不必要开具的抗生素成本，估计每年超过100亿美元；(ii)因不必要的抗生素治疗而产生的副作用，其降低了保健质量，引起并发症和延长的住院治疗(例如过敏反应，抗生素相关性腹泻，肠道酵母等)和(iii)因过度使用而出现的细菌耐药菌株。

微生物病原体对抗生素的抗性正在世界范围内以增速增加(“CDC - Get Smart:Fast Facts About Antibiotic Resistance”2013；“European Surveillance ofAntimicrobial Consumption Network (ESAC-Net)”2014；“CDC - About AntimicrobialResistance”2013；“Threat Report 2013 | Antimicrobial Resistance | CDC”2013)，并具有与抗生素抗性病原体引起的感染相关的发病率和死亡率的同时增加(“Threat Report2013 | Antimicrobial Resistance | CDC”2013)。仅在美国，每年至少有200万人感染抗生素抗性细菌，并且这些感染直接造成至少23,000人死亡(“Threat Report 2013 |Antimicrobial Resistance | CDC”2013)。在欧盟，估计每年有400,000名患者出现耐药细菌菌株，其中有25,000名患者死亡(“WHO Europe -Data and Statistics”2014)。因此，世界卫生组织警告，治疗覆盖将在10年内不足，使世界面临进入“抗生素后时代”的风险，其中抗生素将不再有效对抗传染性疾病(“WHO | Antimicrobial Resistance”2013)。CDC将这一现象视为“在21世纪世界上最紧迫的健康问题之一”(“CDC - About AntimicrobialResistance”2013)。

抗生素处方不足也不少见。例如，在美国，高达15％的成人细菌性肺炎住院患者接受了延迟的Abx治疗或无Abx治疗，即使在这些情况下，早期治疗可以挽救生命并减少并发症。

传染病诊断技术具有减少与抗生素滥用相关的相关健康和经济负担的潜力。理想情况下，这种技术应该：(i)准确区分细菌和病毒感染；(ii)是快速的(在几分钟内)；(iii)能够区致病菌和分作为身体自然菌群一部分的非致病菌；(iv)区分混合的共感染和纯病毒感染；和(v)可适用于无法获得病原体的病例(如窦炎、肺炎、中耳炎、支气管炎等)。

正确鉴定细菌患者是非常重要的，因为这些患者需要抗生素治疗，并且在某些情况下需要更积极的管理(住院治疗、额外的诊断测试等)。细菌患者的误分类增加了发病率和死亡率的几率。因此，需要增加区分细菌和病毒感染的诊断测试的灵敏性，即使以降低特异性为代价。

另外的背景技术包括美国专利申请号20080171323、WO2011/132086和WO2013/117746。

发明概述