[发明专利]PNA探针

权利要求书

1.PNA寡聚体，其中所述PNA寡聚体具有通式：

其中：G是带电部分，或能够在预定pH下携带电荷的部分；

NB是核碱基；和

l≥1；m≥1；n≥0。

2.权利要求1的PNA寡聚体，其中n≥1。

3.权利要求1的PNA寡聚体，其中所述寡聚体中PNA单元的总数(l+m+n)在12-24的范围内。

4.权利要求1的PNA寡聚体，其中在其各自的γ位包含带电部分或能够在预定pH下携带电荷的部分的重复单元的数目，和/或式(V)中具有“G”部分的单元的数目在3-5的范围内。

5.权利要求1的PNA寡聚体，其中在其各自的γ位包含带电部分或能够在预定pH下携带电荷的部分的重复单元的数目和/或式(V)中具有“G”部分的单元的数目与重复单元的总数的比例在1:10-1:2的范围内。

6.权利要求1的PNA寡聚体，其中m＝1。

7.权利要求1的PNA寡聚体，其中PNA分子与固体支持物共价连接。

8.PNA单体，其具有通式：

其中：G是带电部分，或能够在预定pH下携带电荷的部分；

P₁是保护基团P；

P₃是氢或是保护基团P。

9.权利要求8的PNA单体，其中所述PNA单体具有通式：

其中：Fmoc是芴基甲氧基羰基。

10.权利要求1的PNA寡聚体，其中G为带电部分。

11.权利要求10的PNA寡聚体，其中G包含一个或多个带负电荷的基团，选自由羧酸盐或酯、磺酸盐或酯、硫酸盐或酯、膦酸盐或酯、磷酸盐或酯组成的组。

12.权利要求10的PNA寡聚体，其中G包含一个或多个带正电荷的基团，选自由胍鎓、季铵、鏻、锍组成的组。

13.权利要求10的PNA寡聚体，其中G包含一个或多个中性基团，所述中性基团在第一pH下不带电荷，但能够在第二或预定pH下携带电荷。

14.权利要求13的PNA寡聚体，其中G选自胺、酰肼、肼、胍、烷氧基胺、磺酸和/或其衍生物、和/或膦酸和/或其衍生物。

15.权利要求10的PNA寡聚体，其中G是能够在6-8的pH范围内带电荷的基团。

16.根据权利要求1至7中任一项的PNA寡聚体在遗传分析方法中的用途。

17.用于制备根据权利要求8或9任一项的PNA单体的方法，该方法包括：

提供根据式(A3)的化合物；

使式(A3)化合物与保护基团P反应；和

水解；

其中G是带电部分，或能够在预定的pH下携带电荷的部分，和

其中P₁是保护基团。

18.用于制备根据权利要求1至7中任一项的PNA寡聚体的方法，该方法包括使根据权利要求8或9的一种或多种所述PNA单体反应以形成所述PNA寡聚体。

19.根据权利要求18所述的方法，所述方法包括通过其C-末端将PNA单体共价键合在固体支持物上的预备步骤。

20.表征核酸序列中的核苷酸的方法，所述方法包括以下步骤：

(a)使核酸与根据权利要求1至7中任一项的肽核酸(PNA)寡聚体接触，所述PNA寡聚体能够与核酸的一部分杂交以形成核酸/PNA双链；和

(b)使所述核酸/PNA双链与选自下组的一种或多种修饰碱基接触：

其中Y是能够可逆共价反应的官能团；

X₁-X₄是可检测标签、间隔-标签组合或氢；和

Z是碳或氮；

其中PNA寡聚体包含能够与官能团Y可逆地反应的部分，并且其中与核酸/PNA双链整合的修饰碱基与待表征核苷酸的碱基互补，所述核苷酸通过质谱法或通过修饰碱基的可检测标签来表征。