[发明专利]基于CRISPR的文库制备和测序的方法和系统

权利要求书

1.一种用于改进微生物群系测序的方法，所述微生物群系测序用于表征与生物样品相关的用户的微生物有关病症，所述方法包括：

·针对靶标集合产生含内切核酸酶和gRNA的向导RNA(gRNA)复合物，所述靶标集合对应于与所述微生物有关病症关联的分类单位群集合；

·用所述gRNA复合物处理所述生物样品以产生微生物核酸片段，所述微生物核酸片段包含与所述靶标集合相关的末端区域集合；

·用衔接子集合连接所述末端区域集合，所述衔接子集合共享衔接子序列并配置为便于对所述靶标集合进行下一代测序；

·基于经连接的末端区域集合和共享与所述衔接子序列相关的引物序列的引物组扩增靶标集合；

·基于经扩增的靶标集合为所述用户生成微生物序列数据集；和

·基于所述微生物序列数据集确定用户对微生物有关病症的微生物群系相关表征，其中，所述微生物群系相关表征被配置为促进所述用户的微生物群系的改变以改善所述微生物有关病症的状态。

2.权利要求1所述的方法，其中，扩增所述靶标集合是基于由共享所述引物序列的引物组成的引物组以减少扩增偏差。

3.权利要求1所述的方法，其中，扩增所述靶标集合包括用下一代测序平台的桥式扩增基质，基于所述引物组和所述衔接子集合执行多重扩增，并且其中，产生所述微生物序列数据集包括在计算系统产生所述微生物序列数据集，所述计算系统能够操作以与所述下一代测序平台通信。

4.权利要求1所述的方法，其中，产生所述gRNA复合物包括基于用于优化中靶活性的gRNA设计因素集合对gRNA序列进行排序。

5.权利要求4所述的方法，其中，所述gRNA设计因素包括以下项中的至少一种：折叠能量因素、杂交因素、GC含量因素、核苷酸运行因素、第一结合能因素、第二结合能因素和GC钳因素。

6.权利要求4所述的方法，其中，所述gRNA用于与16S rRNA区域相关的靶标集合。