[发明专利]表征植物内生菌的方法在审
| 申请号： | 201780062831.3 | 申请日： | 2017-08-11 |
| 公开（公告）号： | CN110088298A | 公开（公告）日： | 2019-08-02 |
| 发明（设计）人： | G·C·施潘根贝格;K·M·格思里奇;R·曼恩;T·I·索布里奇;P·N·艾卡纳亚克;I·K·海蒂亚拉赫齐格;N·D·布罗海尔;S·J·罗切福特;J·埃德沃兹 | 申请（专利权）人： | 维多利亚农业服务控股公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12N1/14 |
| 代理公司： | 北京北翔知识产权代理有限公司 11285 | 代理人： | 曲蕾;吴溪 |
| 地址： | 澳大利亚*** | 国省代码： | 澳大利亚;AU |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 真菌 测序 遗传变异 遗传分析 编码蛋白质 植物内生菌 真菌侵染 非编码 基因 评估 | ||
1.一种选择和/或表征真菌的方法，所述方法包括对真菌进行遗传分析，其中遗传分析包括：
对一个或多个非编码nrDNA区域进行测序；
对编码蛋白质的基因的一个或多个区域进行测序；
评估测序区域的遗传变异；和
任选地选择具有所需遗传变异的真菌。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述nrDNA选自编码小亚基(SSU)的基因、编码大亚基(LSU)的基因和5.8S nrDNA及其片段中的一种或多种。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述非编码nrDNA选自ETS、NTS或ITS间隔区中的一种或多种。
4.根据权利要求3的方法，其中所述非编码nrDNA是ITS间隔区。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述编码蛋白质的基因不是高度保守的基因。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述编码蛋白质的基因选自tub2基因、tefA基因和act1基因及其片段中的一种或多种。
7.根据权利要求6所述的方法，其中所述编码蛋白质的基因是tub2基因。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述真菌是植物的植物内生菌。
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述植物是草。
10.根据权利要求9所述的方法，其中所述草是牧草、草皮草、生物能源草。
11.根据权利要求10所述的方法，其中所述草是臂形草属-尾稃草属复合体的植物。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的方法，其中所述方法还包括对所述真菌进行形态分析的步骤。
13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法，其中所述方法还包括对所述真菌进行代谢分析的步骤。
14.根据权利要求1-13中任一项的方法，其中所述方法还包括评估所述真菌的地理来源的步骤。
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