[发明专利]用于病原体的鉴定和定量的光谱学系统和方法

权利要求书

1.一种用于检测由患者生物流体衍生的样品中的致病物的系统，所述系统包括：

与通信网络偶联的接收器；

与所述接收器偶联的控制器，所述控制器包括处理器和存储器，并且所述控制器被配置为：

生成样品的红外光谱，所述样品光谱包含一个或多个样品光谱成分，所述样品光谱成分包括样品波数和样品吸光度值；

提供包括一个或多个参考光谱成分的一组参考光谱模型，所述参考光谱成分包括参考波数和参考吸光度值，其中所述参考光谱成分包含与脓毒症有关的一个或多个病原体特征；

使用所述参考光谱模型将所述一个或多个样品光谱成分分类为致病性的或非致病性的；和

使用所分类的样品光谱成分生成病原体数据。

2.一种用于检测由患者生物流体衍生的样品中的致病物的系统，所述系统包括：

与通信网络偶联的接收器；

与所述接收器偶联的控制器，所述控制器包括处理器和存储器，并且所述控制器被配置为：

将所述样品的红外光谱记录到所述存储器，所述样品光谱包括一个或多个光谱成分，所述样品光谱成分包括样品波数和样品吸光度值；

提供包括一个或多个参考光谱成分的一组参考光谱模型，所述参考光谱成分包括参考波数和参考吸光度值，其中所述参考光谱成分包括一个或多个病原体特征，所述病原体特征包括致病性细胞数量；

使用所述参考光谱模型将所述一个或多个样品光谱成分分类为致病性的；

使用所述参考光谱模型计算样品中致病性细胞的数目；和

使用所分类的样品光谱成分和计算的致病性细胞的数目生成病原体数据。

3.一种对患者中的病原体进行筛选的方法，所述方法包括：

使用过滤器从患者生物流体提取试验样品；

将所述试验样品施加到ATR晶体或红外/拉曼衬底；

将来自红外-可见光谱的电磁波束递送通过所述试验样品；和

检测试验样品的吸光度和波束散射中的至少一者，以评价病原体的存在。

4.权利要求3的方法，其中提取所述病原体包括：

使用过滤器从所述生物流体分离颗粒样品，

将所述颗粒样品悬浮在溶剂中，

将所述颗粒样品浓缩在一定量溶剂中以形成浓缩的试验样品。

5.权利要求3或4的方法，所述方法进一步包括分析所述样品对所述电磁波束的吸收或散射以鉴定病原体。

6.权利要求3至5任一项的方法，其中所述电磁波束是衰减性红外光束。

7.权利要求3或4任一项的方法，所述方法进一步包括通过将试验样品对电磁波束的吸收或散射与数据库或与病原体的光谱模型相比较来鉴定与病原体类型对应的分子表型。

8.一种对患者中的病原体进行筛选的方法，所述方法包括：

在粒子的存在下离心来自所述患者的生物流体样品；

将来自红外-可见光谱的电磁波束递送通过患者生物流体样品；和

检测与至少一种病原体有关的粒子的存在。

9.权利要求8的方法，其中使用血清分离管来离心所述生物流体样品。

10.权利要求8的方法，所述方法进一步包括：

分析所述样品对电磁波束的吸收或散射以检测与病原体有关的粒子的存在。

11.权利要求8至10任一项的方法，所述方法进一步包括：

使用所述吸收或散射来鉴定所述病原体。

12.权利要求11的方法，其中鉴定所述病原体包括通过将所述样品对电磁波束的吸收或散射与数据库或与病原体的光谱模型相比较来鉴定对病原体类型具有特异性的分子表型。

13.权利要求3至12任一项的方法，所述方法进一步包括确定所述试验样品中病原体的定量浓度。