[发明专利]用于多瘤病毒的免疫疗法

说明书

本文提供在癌症或多瘤病毒感染的治疗中有用的与多瘤病毒表位相关的方法和组合物。

相关申请

本申请要求于2016年9月9日提交的美国临时专利申请序列号62/385456的优先权的权益，其通过引用被整体并入本文。

背景

多瘤病毒是普遍存在的病毒，其感染许多各种不同的哺乳动物物种。目前，已经鉴别了超过12种不同的人类多瘤病毒物种(包含BK多瘤病毒(BKV)、约翰坎宁安(JohnCunningham)多瘤病毒(JCV)、以及默克尔细胞多瘤病毒(MCV))。

虽然具有免疫能力的宿主中临床上明显的疾病通常是罕见的，但大多数人类多瘤病毒疾病在儿童期获得。BKV病毒和JCV病毒通常可能潜伏在淋巴器官、神经元组织和肾脏中。然而，在免疫抑制的情况下，JCV和BKV两者都再激活并且可能发展为显著的器官疾病。例如，BKV是亲尿道上皮内的，并且BKV的再激活引起一种形式的间质性肾炎(被称为BK多瘤病毒相关性肾病)，其通常与早期未被识别的高移植物丢失有关。亲神经性JC病毒可以进入脑并且引起进行性多病灶性脑白质病(一种具有高死亡率的中枢神经系统的脱髓鞘疾病)。各种多瘤病毒也已经与不同形式的癌症有关。例如，MCV已经与默克尔细胞癌(一种罕见但攻击性形式的皮肤癌)有关。不存在已知的用于治疗多瘤病毒的有效抗病毒剂。因此，需要新的疗法来治疗和预防多瘤病毒感染和/或多瘤病毒相关性癌症。

概述

本文提供与多瘤病毒表位(例如，表1、表2、表3、表4和/或表5中列出的表位)相关的组合物和方法，所述多瘤病毒表位通过T淋巴细胞(例如，细胞毒性T淋巴细胞(CTL)和/或辅助性T淋巴细胞)被识别，并且在多瘤病毒感染(例如，BKV病毒感染、JCV病毒感染、或MCV病毒感染)和/或癌症(例如，多瘤病毒相关性癌症(如BKV相关性癌症、JCV相关性癌症、或MCV相关性癌症))的预防和/或治疗中是有用的。在一些实施方案中，组合物和方法涉及BKV表位(例如，表1中列出的表位)。在一些实施方案中，本文提供的组合物和方法涉及JCV表位(例如，表2中列出的表位)。在一些实施方案中，组合物和方法涉及被并入病毒株内和/或遍及相关病毒株发现的序列变异的杂合表位(例如，表3中列出的表位)。

在某些方面，本文提供蛋白质(例如，分离的蛋白质)，所述蛋白质(例如，分离的蛋白质)包括来自一个或更多个BKV抗原(例如，来自LTA病毒抗原、STA病毒抗原或VP1病毒抗原的表位(如表1中列出的表位))、一个或更多个JCV抗原(例如，来自LTA病毒抗原、STA病毒抗原或VP1病毒抗原的表位(如表2中列出的表位))和/或一个或更多个杂合表位(例如，表3中列出的表位)的一个或更多个表位。在一些实施方案中，多肽包括多个这样的表位。在一些实施方案中，多肽还包括多个表位中的至少两个之间的间插氨基酸序列。在一些实施方案中，蛋白质能够在施用至受试者(例如，哺乳动物受试者(如人受试者))时引起免疫应答。