[发明专利]治疗含融合基因的癌症的方法

说明书

本发明涉及治疗挟带一种或多种特定融合基因的癌症患者的方法。它至少部分基于以下发现：由MAN2A1‑FER融合基因编码的蛋白质显示激酶活性，并且靶向MAN2A1‑FER的酪氨酸激酶抑制剂的使用在除前列腺癌之外的癌症(例如肝细胞癌)中导致异种移植了癌症的动物的存活率显著提高。

优先权信息

本申请要求2016年12月13日提交的美国临时专利申请系列号62/433,600的优先权，其通过引用全文纳入本文。

资助信息

本发明是在美国国立卫生研究院授予的批准号RO1 CA098249和美国军队医学研究和物资司令部授予的W81XWH-16-1-0364的政府支持下完成的。政府对本发明拥有一定的权利。

1.介绍

本发明涉及治疗挟带一种或多种特定融合基因的患者的方法。

2.背景技术

在美国，前列腺癌是男性中观察到的最常见的恶性肿瘤之一。2014年，前列腺癌的死亡率达到27540，是男性第二大致命癌症(Siegel等.(2015)A Cancer Journal ForClinicians 65:5-29))。如WO 2015/103057和WO 2016/011428中所公开的，在已经显示出复发和致死的前列腺癌中鉴定了由染色体重排产生的许多融合基因。这些融合基因的表达在侵袭性前列腺癌中广泛存在，但不存在于正常组织中。WO 2015/103057公开了用酪氨酸抑制剂处理表达MAN2A1/FER融合基因的前列腺癌细胞，导致前列腺癌细胞的体外细胞死亡。

一般而言，在美国，癌症是导致死亡的主要原因之一。仅在美国，2015年癌症死亡率就达到了595690，成为心血管疾病后死亡的第二大致命原因(Siegel等.(2016)A CancerJournal For Clinicians 66(1):7-30)。肝癌是全世界男性和女性癌症相关死亡的主要原因之一(Jemal等.(2011)全球癌症统计(Global cancer statistics).CA Cancer J Clin61:69-90)。尽管在过去几十年中取得了重大进展，但关于癌症发展和进展的机制仍有许多尚待理解。癌症的治疗，特别是转移性癌症的治疗仍然存在问题，并且癌症的治愈仍然是难以捉摸的。因此，本领域仍需要治疗癌症的方法。

3.发明概述

本发明涉及治疗患有癌症或携带一种或多种特定融合基因的恶变前或肿瘤病症的患者的方法。它至少部分基于以下发现：由MAN2A1-FER融合基因编码的蛋白质显示激酶活性，并且靶向MAN2A1-FER的酪氨酸激酶抑制剂的使用在除前列腺癌之外的癌症(例如肝细胞癌)中导致携带癌症异种移植物的动物的存活率显著提高。

在不同非限制性实施方式中，本发明提供了用于鉴定对象中的融合基因的方法和组合物，所述对象例如患有或疑似患有癌症或肿瘤或恶变前病症的对象。在一些实施方式中，癌症不是前列腺癌。在某些实施方式中，癌症不是肺腺癌、多形性胶质母细胞瘤或肝细胞癌。此类融合基因包括TRMT11-GRIK2，SLC45A2-AMACR，MTOR-TP53BP1，LRRC59-FLJ60017，TMEM135-CCDC67，KDM4B-AC011523.2，MAN2A1-FER，PTEN-NOLC1，CCNH-C5orf30，ZMPSTE24-ZMYM4，CLTC-ETV1，ACPP-SEC13，DOCK7-OLR1和PCMTD1-SNTG1。此外，基于特定融合基因的存在，本发明提供了治疗携带一种或多种特定融合基因的对象的方法，例如，通过给予治疗有效量的融合基因特异性试剂。在某些实施方式中，融合基因是MAN2A1-FER。