[发明专利]与对靶向艰难梭菌毒素B的治疗的响应相关的人类遗传标志物

说明书

本发明提供与靶向艰难梭菌(C.difficile)毒素B(TcdB)的治疗(例如TcdB抗体)的有益响应相关的人类6号染色体上的遗传标志物。这些TcdB治疗响应标志物可以用于，特别是在治疗患有易受TcdB抗体治疗影响的疾病的患者的方法中和为这样的患者选择最合适的疗法的方法中，鉴定最可能受益于采用靶向TcdB的疗法治疗的患者。本发明还提供可以与本发明的TcdB治疗响应标志物一起使用的抗体、药物产品和试剂盒。

技术领域

本发明涉及人类6号染色体上的遗传标志物，所述遗传标志物预测对用靶向有需要的患者中的艰难梭菌毒素B的分子进行的治疗的有益响应。本发明还提供使用遗传标志物诊断和/或治疗所述患者的方法。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2017年5月18日提交的当前未决的美国临时申请序列号62/508,066以及于2016年12月14日提交的当前未决的国际申请号PCT/CN16/109900的权益。

背景技术

艰难梭菌(C.difficile)是厌氧、形成孢子的革兰氏阳性杆菌，是在美国(U.S.)和欧洲的卫生保健获得性感染的最常见原因(Lessa等，Burden of Clostridium difficileinfection in the United States.N Engl J Med.2015 372(9):825-34)。美国疾病控制中心(CDC)已经宣布艰难梭菌是一种紧急的公共卫生威胁(Center for Disease Controland Prevention.Antibiotic resistance threats in the United States,2013.Atlanta,GA:U.S.,Department of Health and Human Services)。根据CDC，据估计在2011年艰难梭菌是几乎五十万的感染的原因，包括在美国的453,000例估计的艰难梭菌感染(CDI)病例以及另外的83,000例复发病例(Lessa等，同上)。CDI还与大约29,000例死亡有关(Lessa等，2015，同上)。欧洲研究报告了类似的CDI复发率估计值(Bauer等Clostridium difficile infection in Europe:a hospital-based survey.Lancet2011；377:63-73)。

几乎所有抗生素，包括克林霉素、头孢菌素、青霉素和氟喹诺酮类都与由产毒性艰难梭菌引起的症状性疾病有关(Bartlett,J.G.,Clin Infect Dis.46(10):1489-92(2008)；Gorbach,S.L.,N Engl J Med,341(22):1690-1(1999)；Kelly等,N Engl J Med330(4):257-62(1994))。艰难梭菌相关疾病包括抗生素相关性腹泻、结肠炎和伪膜性结肠炎，并且在某些情况下，可能发展为中毒性巨结肠、败血症和死亡。虽然一些患有CDI的患者响应于抗生素治疗的中止，大多数需要用另外的试剂进行治疗，例如甲硝唑或万古霉素(在DuPont等,Current Opinion in Infectious Diseases 21:500-507(2008)中综述)。现有疗法通常无法消除CDI或导致复发疾病；因此，需要预防性或治疗性治疗的新方法。