[发明专利]通过微生物宏基因组分析来诊断乳腺癌的方法

权利要求书

1.一种为乳腺癌诊断提供信息的方法，该方法包括：

(a)从分离自受试者样品的细胞外囊泡中提取DNA；

(b)使用具有SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的成对的引物对所提取的所述DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及

(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述比较并确定包括比较并确定：来源于选自由梭杆菌门(Fusobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、柔膜菌门(Tenericutes)、装甲菌门(Armatimonadetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和TM7门组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述比较并确定包括比较并确定：来源于选自由梭杆菌纲(Fusobacteriia)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、叶绿体纲(Chloroplast)、TM7-3纲、拟杆菌纲(Bacteroidia)、柔膜细菌纲(Mollicutes)、菌毛单胞菌纲(Fimbriimonadia)、疣微菌纲(Verrucomicrobiae)、腐螺旋菌纲(Saprospirae)和4C0d-2纲组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述比较并确定包括比较并确定：来源于选自由梭杆菌目(Fusobacteriales)、鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)、奈瑟氏球菌目(Neisseriales)、根瘤菌目(Rhizobiales)、红螺菌目(Rhodospirillales)、放线菌目(Actinomycetales)、芽孢杆菌目(Bacillales)、木霉菌目(Streptophyta)、柄杆菌目(Caulobacterales)、假单胞菌目(Pseudomonadales)、拟杆菌目(Bacteroidales)、肠杆菌目(Enterobacteriales)、双歧杆菌目(Bifidobacteriales)、不等鞭毛目(Stramenopiles)、RF39目、菌毛单胞菌目(Fimbriimonadales)、疣微菌目(Verrucomicrobiales)、腐螺旋菌目(Saprospirales)、伯克氏菌目(Burkholderiales)、双歧杆菌目(Bifidobacteriales)、海洋螺菌目(Oceanospirillales)和YS2目组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。