[发明专利]用于血清型A型口蹄疫病毒的嵌合疫苗

说明书

描述了合成的口蹄疫病毒(FMDV)嵌合多肽和编码嵌合多肽的核酸分子。所述嵌合多肽比天然存在的FMDV多肽具有更大的T细胞表位覆盖度，并且包括常见的FMDV表位，但排除了罕见的FMDV表位。当作为FMDV基因组的一部分包括时，所述嵌合多肽允许病毒复制并组装至FMDV颗粒中。嵌合多肽和核酸组合物可用于引发免疫应答，其提供针对广泛范围的血清型A型FMDV毒株的保护。

交叉引用

本申请根据35U.S.C.§119(e)要求享有于2016年10月31日提交的美国临时系列号：62/415,124的优先权，其内容通过引用以其整体并入本文。

发明领域

本发明涉及合成的口蹄疫病毒(FMDV)多肽和核酸及其用于诱导针对血清型A型FMDV的广泛免疫应答的用途。

致谢政府支持

本发明是在合同号为DE-AC0576RLO1830，由美国能源部提供资金的政府支持下进行的。政府对发明享有一定的权利。

发明背景

FMDV在其目前流行的地区引发具有重大经济影响的家畜疾病。此外，如果将FMDV引入无FMDV区域，他可能会造成巨大的经济损失。目前的“杀死，焚烧和掩埋”爆发控制策略因为经济，人道和战略原因而不能令人满意(Breeze，Biosecur Bioterro 2(4)：254-264,2004)。虽然疫苗接种可以是疫情管理的主要部分，但基于灭活病毒的可获得的疫苗在成本、生产安全性、免疫持续时间和保护范围方面都不能令人满意(Rodriguez和Gay,ExpertRev Vaccines 10(3):377-387,2011；Robinson等人,Transbound Emerg Dis 63(Suppl1):30-41,2016)。FMDV在北美、欧盟、澳大利亚和新西兰之外广泛流行。FMDV在环境中是持久的，并且具有高度传染性。FMDV在美国爆发的直接经济影响估计为数百亿至数千亿美元，快速且广泛的疫苗接种可能会使成本降低一半(Schroeder等人,Journal ofAgricultural and Applied Economics 47:47-76,2015)。

FMDV具有七种主要血清型，四种广泛分布(A、O、C和亚洲-1)，并且三种主要在撒哈拉以南非洲(SAT-1、SAT-2和SAT-3)发现。血清型内部多样性很高，并且即使在相同血清型的分离株之间也几乎没有交叉保护。鉴于这种多样性，每次爆发都需要对许多疫苗株之一进行野外匹配。FMDV疫苗的最新发展已经导致许多领域的改进(Robinson等人，TransboundEmerg Dis 63(Suppl 1)：30-41,2016)，但保护范围仍然有限；大多数疫苗只能保护与疫苗株密切相关的爆发，因此防止所有可能的爆发需要过多的大量库存。

因此，仍然需要改善疫苗诱导的对不同FMDV毒株的保护范围。

发明概述

本文公开了FMDV嵌合多肽，其与天然FMDV多肽相比提供了更高水平的T细胞表位覆盖度，具有最小限度的非天然和稀有表位。本文公开的嵌合多肽和核酸组合物可用于引发免疫应答，所述免疫应答提供针对广泛范围的血清型A型FMDV毒株的保护。

本文提供了合成的FMDV多肽，其具有与嵌合多肽VP4.2.1(SEQ ID NO：2)或嵌合多肽VP4.2.2(SEQ ID NO：4)至少98％相同的氨基酸序列。还提供了包含嵌合多肽的重组FMDV。

还提供了编码嵌合VP4.2.1和VP4.2.2多肽的核酸分子和载体。在一些实施方案中，载体包括剩余FMDV蛋白的编码序列，使得在将载体转染到允许的宿主细胞中时，产生传染性FMDV。

本发明还提供了包含一种或两种嵌合FMDV多肽的组合物，或编码一种或两种嵌合FMDV多肽的核酸分子。在一些实例中，组合物包括重组FMDV，其包含嵌合多肽，或两个重组FMDV，各自具有不同的嵌合FMDV多肽。