[发明专利]自适应纳米孔信号压缩

权利要求书

1.一种操作被配置成并行地对至少100,000个DNA分子进行测序的测序系统的方法，所述方法包括在预处理电路处执行：

从包括多个单元的传感器芯片接收数据帧的第一集合，其中所述多个单元中的每个单元被配置成生成检测信号以用于确定随时间的单元的状态，并且其中每个数据帧包括来自所述多个单元的检测信号并且对应于不同的时间；

从所述数据帧的第一集合中的所述多个单元的检测信号提取信息以获得第一摘要信息，所述第一摘要信息用于确定所述多个单元的状态；

生成具有一个或多个摘要帧的第一群组，第一群组包括从所述数据帧的第一集合提取的第一摘要信息，其中所述具有一个或多个摘要帧的第一群组中的摘要帧的数目小于所述数据帧的第一集合中的数据帧的数目；以及

将所述具有一个或多个摘要帧的第一群组发送到处理器以用于确定所述多个单元的状态，

所述检测信号包括在一个或多个AC信号循环中的数据点，每个AC信号循环包括亮时段和暗时段，其中所述检测信号包括在所述一个或多个AC信号循环中每一个的亮时段中的一个或多个数据点以及在所述一个或多个AC信号循环中的每一个的暗时段中的一个或多个数据点；并且

所述一个或多个摘要帧中的每一个包括针对所述多个单元中每一个的：

在AC信号循环的亮时段中的第一数据点与AC信号循环的暗时段中的第一数据点之间的差异；

在AC信号循环的亮时段中的最后的数据点与AC信号循环的暗时段中的最后的数据点之间的差异；

在亮时段中的最后的数据点与下一个暗时段中的第一数据点之间的差异；

在暗时段中的最后的数据点与下一个亮时段中的第一数据点之间的差异；或

在AC信号循环的暗时段中的两个数据点之间的差异。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述具有一个或多个摘要帧的第一群组包括来自所述数据帧的第一集合的一个或多个数据帧。

3.根据权利要求1所述的方法，其中单元的状态选自包括以下各项的群组：

单元的断开状态或短路状态；

单元中的双层的存在或不存在；

单元中纳米孔的存在或不存在；

与单元相关联的碱基；或

以上各项的任何组合。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述数据帧的第一集合包括来自传感器芯片的数据帧，所述来自传感器芯片的数据帧在所述多个单元的形成期间被生成。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述数据帧的第一集合包括来自传感器芯片的数据帧，所述来自传感器芯片的数据帧在所述多个单元的校准期间被生成。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述数据帧的第一集合包括来自传感器芯片的数据帧，所述来自传感器芯片的数据帧在测序循环中被生成。

7.根据权利要求1所述的方法，其中所述数据帧的第一集合包括来自传感器芯片的数据帧，所述来自传感器芯片的数据帧在多个测序循环中被生成。

8.根据权利要求1所述的方法，还包括：

生成帧图，所述帧图标识所述具有一个或多个摘要帧的第一群组的特性。

9.根据权利要求1所述的方法，还包括：

接收对于以下的请求：通过使用来自传感器芯片的数据帧的第二集合来生成具有一个或多个摘要帧的第二群组；

基于所述请求来从所述数据帧的第二集合中的所述多个单元的检测信号提取信息以获得第二摘要信息，所述第二摘要信息用于确定所述多个单元的状态；

生成所述具有一个或多个摘要帧的第二群组，第二群组包括从所述数据帧的第二集合提取的第二摘要信息；以及

将所述具有一个或多个摘要帧的第二群组发送到处理器。