[发明专利]多级样品回收系统

说明书

提供了多级样品回收系统，其包含自动化2级和3级样品回收系统。此类系统实现从高通量筛选系统(包含利用大规模微毛细管阵列的系统)中快速筛选并回收样品，所述样品包含基于活细胞的样品。在具体筛选系统中，每个微毛细管包括含有变体蛋白质、固定化靶分子和报告元件的溶液。固定化靶分子可以包含任何所关心的分子，包含蛋白质、核酸、碳水化合物和其它生物分子。通过测量来自所述报告元件的信号来评估变体蛋白质与分子靶标的缔合。可以使用本文公开的多级系统鉴别和回收在测定中被鉴别为含有所关心的变体蛋白质的微毛细管的内容物。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2016年12月30日提交的美国临时申请第62/441,128号的权益，所述美国临时申请的全部内容明确地通过引用整体并入本文。

背景技术

生物样品的分析，包含蛋白质、核酸、碳水化合物和其它重要的生物分子的鉴别、表征以及重新工程化，已经大大获益于样品数的增加和样品大小的减小。例如，如DNA微阵列等二维生物材料微阵列已经实现了对涉及用于处理样品和检测结果的多重方法的高通量筛选方法的开发。

以上方法已经在一些情况下获益于其与用于使用荧光或其它对应的特异性且敏感的标记方法鉴别所关心的样品的光学感测技术的组合。

虽然这种技术提供有关特定样品的分析的信息，例如溶液中存在特定生物分子和潜在地所述生物分子的量或者特定核酸或多肽的序列，但是在不使所关心的样品失活或未以其它方式损坏所关心的样品的情况下，所述技术不能实现对通过测定鉴别的生物样品的回收。

因此，需要继续开发具有高通量能力的改进的微量筛选和分析方法和系统，并且尤其是实现对在筛选和分析中鉴别的样品的回收的方法和系统。

发明内容

本公开通过在一方面提供多级样品回收系统来解决这些或其它需要，所述多级样品回收系统包括：

筛选阵列级，其中所述筛选阵列级相对于显微镜物镜在两个维度上是可控的并且被配置成与筛选阵列可逆关联；以及

第一回收阵列级，其中所述第一回收阵列级相对于所述显微镜物镜在至少一个维度上是可控的并且被配置成与回收阵列可逆关联；

其中所述筛选阵列级和所述第一回收阵列级是能彼此独立控制的。

在一些实施例中，本公开的多级样品回收系统进一步包括与所述筛选阵列级可逆关联的筛选阵列和与所述第一回收阵列级可逆关联的回收阵列。

在一些实施例中，所述系统进一步包括提取束发生器，所述提取束发生器通过所述筛选阵列级中的孔光学地耦合到所述筛选阵列中的微型样品容器。

在一些实施例中，所述系统进一步包括第二回收阵列级。

附图说明

图1A-1C示意性地展示了示例性微毛细管筛选测定的步骤。每个图中的左侧图示是从单个微毛细管的侧面观看的横截面视图。每个图中的右侧图示是微毛细管阵列的一小部分的仰视图。每种情况下的阴影旨在展示如荧光等电磁信号。

图2A-C示出了微毛细管阵列的一小部分的仰视图，所述仰视图展示了针对哺乳动物细胞的杂交瘤筛选，其中使用明视场(图2A)、LiveGreen(图2B)或荧光抗小鼠第二抗体(图2C)对细胞进行成像。

图3示出了含有A431靶细胞和杂交瘤细胞的微毛细管在4小时的孵育过程中的图像。

图4A和图4B示出了微毛细管阵列的一小部分的图像，所述图像针对哺乳动物细胞突出显示了表达和非表达酵母细胞，其中使用明视场(图4A)或荧光抗体(图4B)对细胞进行成像。

图5A-5G展示了永生化人类细胞在微毛细管阵列中在6天的过程中的生长。