[发明专利]一种分布式基因大数据存储平台在审
| 申请号： | 201810024030.4 | 申请日： | 2018-01-14 |
| 公开（公告）号： | CN110120247A | 公开（公告）日： | 2019-08-13 |
| 发明（设计）人： | 陈墩金;祁建明;周峻松;徐继峰 | 申请（专利权）人： | 广州明领基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B50/00;H03M7/30;H03M7/40 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 510610 广东省广州市天河区*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 压缩 大数据 存储平台 算术编码 游程编码 质量分数 碱基 基因 分布式框架 数据流 比对结果 表达信息 成元数据 存储空间 匹配工具 数据分割 数据节点 元数据流 基因组 冗余性 比对 去除 存储 参考 重复 保证 | ||
【权利要求书】：
1.一种分布式基因大数据存储平台，其特征在于：所述平台包括数据读取模块、数据压缩模块、数据存储模块；所述数据读取模块用于读取DNA测序仪得到的FASTQ数据；所述数据压缩模块用于将FASTQ数据分割成元数据、碱基和质量分数三个数据流，并采用不同的压缩算法进行数据压缩；所述数据存储模块用于将压缩后的数据采用分布式的存储方式存入数据库。
2.根据权利要求1所述的一种分布式基因大数据存储平台，其特征在于：所述数据压缩模块将FASTQ数据分割成元数据、碱基和质量分数三个数据流，分别采用LZMA算法、游程编码、算术编码进行压缩。
3.根据权利要求1所述的一种分布式基因大数据存储平台，其特征在于：所述数据存储模块由多个数据节点DataNode和中心节点NameNode组成，由中心节点NameNode将数据分发至各个DataNode节点进行存储。
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