[发明专利]同时检测女性皮肤和发质SNP遗传多态性位点的复合扩增试剂盒及其应用有效
申请号: | 201810035796.2 | 申请日: | 2018-01-15 |
公开(公告)号: | CN108018346B | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 邵泽香;卢文翔;沈虎琴;王佩佩;陈林丽;郭育林;夏子芳;郑卫国 | 申请(专利权)人: | 无锡中德美联生物技术有限公司;南京迪康金诺生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6876 | 分类号: | C12Q1/6876;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 余俊杰 |
地址: | 214174 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 检测 女性 皮肤 snp 遗传 多态性 复合 扩增 试剂盒 及其 应用 | ||
1.同时检测女性皮肤和发质SNP遗传多态性位点的复合扩增试剂盒,其特征在于,试剂盒包含用于检测6个SNP位点基因座的不同碱基类型的引物,所述6个SNP位点基因座为:MC1R rs1805007,NQO1 rs1800566,AQP3 rs17553719,FGFR2 rs4752566,EDAR rs3827760,MMP1 rs1799750;其中rs号表示该位点在dbSNP数据库中的编号;所述引物包括针对各个SNP位点基因座的共用上游引物和特异性下游引物,特异性下游引物于3’末端第2位、第3位或第4位引入错配碱基;
所述引物及其序列如下:
用于检测SNP位点基因座MC1R rs1805007的C/T/G/A碱基类型的共用上游引物为:
SEQ1:5’-ATGAGCACCAGCATGGCTC-3’;
用于检测位点MC1R rs1805007C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ2:5’-TCTCCATCTTCTACGCA
SEQ3:5’-TCTCCATCTTCTACGCAC
SEQ4:5’-TCTCCATCTTCTACGCACT
用于检测位点MC1R rs1805007T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ5:5’-atttCATCTCCATCTTCTACGCA
SEQ6:5’-atttCATCTCCATCTTCTACGCAC
SEQ7:5’-atttCATCTCCATCTTCTACGCACT
用于检测位点MC1R rs1805007G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ8:5’-atttcttTCTCCATCTTCTACGCA
SEQ9:5’-atttcttTCTCCATCTTCTACGCAC
SEQ10:5’-atttcttTCTCCATCTTCTACGCACT
用于检测位点MC1R rs1805007A碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ11:5’-atttGGCATCTCCATCTTCTACGCA
SEQ12:5’-atttGGCATCTCCATCTTCTACGCAC
SEQ13:5’-atttGGCATCTCCATCTTCTACGCACT
用于检测位点NQO1 rs1800566C/T/A碱基类型的共用上游引物为:
SEQ14:5’-GCATGGAAGCTGTTGACTTAC-3’;
用于检测位点NQO1 rs1800566C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ15:5’-CAATGCTATATGTCAGTT
SEQ16:5’-CAATGCTATATGTCAGTT
SEQ17:5’-CAATGCTATATGTCAGTTGA
用于检测位点NQO1 rs1800566T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ18:5’-atttCAATGCTATATGTCAGTT
SEQ19:5’-atttCAATGCTATATGTCAGTTG
SEQ20:5’-atttCAATGCTATATGTCAGTTGA
用于检测位点NQO1 rs1800566A碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ21:5’-atttattCAATGCTATATGTCAGTT
SEQ22:5’-atttattCAATGCTATATGTCAGTTG
SEQ23:5’-atttattCAATGCTATATGTCAGTTGA
用于检测位点AQP3 rs17553719T/G/C碱基类型的共用上游引物为:
SEQ24:5’-AGAGTTTGGGGAGTGCATCG-3’;
用于检测位点AQP3 rs17553719 T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ25:5’-ATCCGCTGCTCGCTGC
SEQ26:5’-ATCCGCTGCTCGCTGCT
SEQ27:5’-ATCCGCTGCTCGCTGCTC
用于检测位点AQP3 rs17553719G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ28:5’-atttATCCGCTGCTCGCTGC
SEQ29:5’-atttATCCGCTGCTCGCTGCT
SEQ30:5’-atttATCCGCTGCTCGCTGC
用于检测位点AQP3 rs17553719C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ31:5’-ttATCCGCTGCTCGCTGCT
SEQ32:5’-ttATCCGCTGCTCGCTGC
SEQ33:5’-ttATCCGCTGCTCGCTGC
用于检测位点FGFR2 rs4752566T/G碱基类型的共用上游引物为:
SEQ34:5’-CTGTGGGTTCCGCATTCAT-3’;
用于检测位点FGFR2 rs4752566T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ35:5’-attACAACCCCGAATATACGTAAA
SEQ36:5’-attACAACCCCGAATATACGTAA
SEQ37:5’-atattACAACCCCGAATATACGTA
用于检测位点FGFR2 rs4752566G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ38:5’-ACAACCCCGAATATACCAAAA
SEQ39:5’-ACAACCCCGAATATACCAAA
SEQ40:5’-ACAACCCCGAATATACCAA
用于检测位点EDAR rs3827760C/T/G碱基类型的共用上游引物为:
SEQ41:5’-GTGCTGATGCGGTCAAAGAGT-3’;
用于检测位点EDAR rs3827760C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ42:5’-ACGTACAACTCTGAGAAG
SEQ43:5’-ACGTACAACTCTGAGAAGGC
SEQ44:5’-ACGTACAACTCTGAGAAGG
用于检测位点EDAR rs3827760T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ45:5’-attACGTACAACTCTGAGAAG
SEQ46:5’-attACGTACAACTCTGAGAAGCC
SEQ47:5’-attACGTACAACTCTGAGAAGC
用于检测位点EDAR rs3827760G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:
SEQ48:5’-attgttACGTACAACTCTGAGAAG
SEQ49:5’-attgttACGTACAACTCTGAGAAGCC
SEQ50:5’-attgttACGTACAACTCTGAGAAGC
用于检测位点MMP1 rs1799750G/-碱基类型的上游引物为:
SEQ51:5’-TCCCACCTTTCCCACTGTATC-3’;
用于检测位点MMP1 rs1799750G/-碱基类型的下游引物为:
SEQ52:5’-TCTTCCCATTCTTCTTACC-3’;
其中,下划线标记的碱基为引入的错配碱基。
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