[发明专利]同时检测女性皮肤和发质SNP遗传多态性位点的复合扩增试剂盒及其应用有效

专利信息
申请号: 201810035796.2 申请日: 2018-01-15
公开(公告)号: CN108018346B 公开(公告)日: 2021-07-30
发明(设计)人: 邵泽香;卢文翔;沈虎琴;王佩佩;陈林丽;郭育林;夏子芳;郑卫国 申请(专利权)人: 无锡中德美联生物技术有限公司;南京迪康金诺生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/6876 分类号: C12Q1/6876;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 余俊杰
地址: 214174 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 同时 检测 女性 皮肤 snp 遗传 多态性 复合 扩增 试剂盒 及其 应用
【权利要求书】:

1.同时检测女性皮肤和发质SNP遗传多态性位点的复合扩增试剂盒,其特征在于,试剂盒包含用于检测6个SNP位点基因座的不同碱基类型的引物,所述6个SNP位点基因座为:MC1R rs1805007,NQO1 rs1800566,AQP3 rs17553719,FGFR2 rs4752566,EDAR rs3827760,MMP1 rs1799750;其中rs号表示该位点在dbSNP数据库中的编号;所述引物包括针对各个SNP位点基因座的共用上游引物和特异性下游引物,特异性下游引物于3’末端第2位、第3位或第4位引入错配碱基;

所述引物及其序列如下:

用于检测SNP位点基因座MC1R rs1805007的C/T/G/A碱基类型的共用上游引物为:

SEQ1:5’-ATGAGCACCAGCATGGCTC-3’;

用于检测位点MC1R rs1805007C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ2:5’-TCTCCATCTTCTACGCATTGC-3’;

SEQ3:5’-TCTCCATCTTCTACGCACGGC-3’;

SEQ4:5’-TCTCCATCTTCTACGCACTTC-3’;

用于检测位点MC1R rs1805007T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ5:5’-atttCATCTCCATCTTCTACGCATTGT-3’;

SEQ6:5’-atttCATCTCCATCTTCTACGCACGGT-3’;

SEQ7:5’-atttCATCTCCATCTTCTACGCACTTT-3’

用于检测位点MC1R rs1805007G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ8:5’-atttcttTCTCCATCTTCTACGCAGTGG-3’;

SEQ9:5’-atttcttTCTCCATCTTCTACGCACGGG-3’;

SEQ10:5’-atttcttTCTCCATCTTCTACGCACTTG-3’

用于检测位点MC1R rs1805007A碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ11:5’-atttGGCATCTCCATCTTCTACGCATTGT-3’;

SEQ12:5’-atttGGCATCTCCATCTTCTACGCACGAT-3’;

SEQ13:5’-atttGGCATCTCCATCTTCTACGCACTTT-3’

用于检测位点NQO1 rs1800566C/T/A碱基类型的共用上游引物为:

SEQ14:5’-GCATGGAAGCTGTTGACTTAC-3’;

用于检测位点NQO1 rs1800566C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ15:5’-CAATGCTATATGTCAGTTCAGG-3’;

SEQ16:5’-CAATGCTATATGTCAGTTACGG-3’;

SEQ17:5’-CAATGCTATATGTCAGTTGATG-3’

用于检测位点NQO1 rs1800566T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ18:5’-atttCAATGCTATATGTCAGTTCAGA-3’;

SEQ19:5’-atttCAATGCTATATGTCAGTTGCGA-3’;

SEQ20:5’-atttCAATGCTATATGTCAGTTGATA-3’

用于检测位点NQO1 rs1800566A碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ21:5’-atttattCAATGCTATATGTCAGTTCAGT-3’;

SEQ22:5’-atttattCAATGCTATATGTCAGTTGTGT-3’;

SEQ23:5’-atttattCAATGCTATATGTCAGTTGATT-3’

用于检测位点AQP3 rs17553719T/G/C碱基类型的共用上游引物为:

SEQ24:5’-AGAGTTTGGGGAGTGCATCG-3’;

用于检测位点AQP3 rs17553719 T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ25:5’-ATCCGCTGCTCGCTGCACCA-3’;

SEQ26:5’-ATCCGCTGCTCGCTGCTGCA-3’;

SEQ27:5’-ATCCGCTGCTCGCTGCTCGA-3’

用于检测位点AQP3 rs17553719G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ28:5’-atttATCCGCTGCTCGCTGCACCG-3’;

SEQ29:5’-atttATCCGCTGCTCGCTGCTAGG-3’;

SEQ30:5’-atttATCCGCTGCTCGCTGCGCTG-3’

用于检测位点AQP3 rs17553719C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ31:5’-ttATCCGCTGCTCGCTGCTAGC-3’;

SEQ32:5’-ttATCCGCTGCTCGCTGCACCC-3’;

SEQ33:5’-ttATCCGCTGCTCGCTGCGCAC-3’

用于检测位点FGFR2 rs4752566T/G碱基类型的共用上游引物为:

SEQ34:5’-CTGTGGGTTCCGCATTCAT-3’;

用于检测位点FGFR2 rs4752566T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ35:5’-attACAACCCCGAATATACGTAAAGA-3’;

SEQ36:5’-attACAACCCCGAATATACGTAAGTA-3’;

SEQ37:5’-atattACAACCCCGAATATACGTAGATA-3’

用于检测位点FGFR2 rs4752566G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ38:5’-ACAACCCCGAATATACCAAAAGC-3’;

SEQ39:5’-ACAACCCCGAATATACCAAATTC-3’;

SEQ40:5’-ACAACCCCGAATATACCAAGATC-3’

用于检测位点EDAR rs3827760C/T/G碱基类型的共用上游引物为:

SEQ41:5’-GTGCTGATGCGGTCAAAGAGT-3’;

用于检测位点EDAR rs3827760C碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ42:5’-ACGTACAACTCTGAGAAGCCTC-3’;

SEQ43:5’-ACGTACAACTCTGAGAAGGCAC-3’;

SEQ44:5’-ACGTACAACTCTGAGAAGGATC-3’

用于检测位点EDAR rs3827760T碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ45:5’-attACGTACAACTCTGAGAAGGCTT-3’;

SEQ46:5’-attACGTACAACTCTGAGAAGCCAT-3’;

SEQ47:5’-attACGTACAACTCTGAGAAGCATT-3’

用于检测位点EDAR rs3827760G碱基类型的特异性下游引物为下列核苷酸序列之一:

SEQ48:5’-attgttACGTACAACTCTGAGAAGGCTG-3’;

SEQ49:5’-attgttACGTACAACTCTGAGAAGCCAG-3’;

SEQ50:5’-attgttACGTACAACTCTGAGAAGCATG-3’

用于检测位点MMP1 rs1799750G/-碱基类型的上游引物为:

SEQ51:5’-TCCCACCTTTCCCACTGTATC-3’;

用于检测位点MMP1 rs1799750G/-碱基类型的下游引物为:

SEQ52:5’-TCTTCCCATTCTTCTTACC-3’;

其中,下划线标记的碱基为引入的错配碱基。

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