[发明专利]一种高效快速的均一化全长cDNA文库构建方法在审
申请号: | 201810035960.X | 申请日: | 2018-01-15 |
公开(公告)号: | CN108193284A | 公开(公告)日: | 2018-06-22 |
发明(设计)人: | 李泽卿 | 申请(专利权)人: | 武汉爱基百客生物科技有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 第一链cDNA 链cDNA 构建 全长cDNA文库 高效快速 均一化 扩增 合成 寡核苷酸引物 噬菌体包装 理论基础 锚定引物 逆转录酶 再次利用 反转录 逆转录 预热的 试管 文库 细菌 保存 改进 | ||
1.一种高效快速的均一化全长cDNA文库构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:选取mDNA,并将mDNA作为合成cDNA第一链的模板,然后将mDNA储存在8-14摄氏度的无菌环境下,且储存时间为45-60min,完成后备用;
S2:将S1中处理后的mDNA在PCR引物以及寡核苷酸引物的引导下,通过逆转录酶逆转录,从而能够合成第一链cDNA,并将第一链cDNA在纯化酶的作用下进行纯化处理,以保证第一链cDNA在使用时的质量;
S3:将纯化时的第一链cDNA需要结束时,将第一链cDNA放到冰上终止反应,然后将第一链cDNA置于试管内,轻弹试管混匀,稍离心甩到管底,然后放置在预热的PCR仪上;
S4:将S3中处理后的第一链cDNA再次利用PCR引物以及锚定引物,利用改进后的Cap-trapper法在PCR仪合成并扩增第二链cDNA,在反应结束后,取适量第二链cDNA在琼脂糖电泳上检测第二链cDNA的合成效果;
S5:取3-6支0.5ml试管,标号后按下表加样,温和地混合第二链cDNA,且需避免产生气泡,稍离心使样品都沉到管底,并在14-20摄氏度的条件下进行过夜;
S6:在S5中的第二链cDNA处理完成后,分别对第二链cDNA做λ噬菌体包装反应,然后测定每个包装后文库的滴度,从上面三个连接重组反应将获得2*106-5*106单克隆,未扩增的第二链cDNA文库在1-4摄氏度的条件下保存12-18天,即构建完成均一化全长cDNA文库。
2.根据权利要求1所述的一种高效快速的均一化全长cDNA文库构建方法,其特征在于:在S4中的在合成第二链cDNA时,需要进行三次的利用PCR仪合成并扩增第二链cDNA,以保证第二链cDNA的准确度。
3.根据权利要求1所述的一种高效快速的均一化全长cDNA文库构建方法,其特征在于:在S6中,如果获得的克隆数少于2*106,重复上面的连接操作,并检查样品的浓度体积以及cDNA的用量。
4.根据权利要求1所述的一种高效快速的均一化全长cDNA文库构建方法,其特征在于:所述的PCR引物具体为:
引物序列P1:ACACGATGCAATGACATATG,
引物序列P2:ACTGATACGGAGACGATAGA。
5.根据权利要求1所述的一种高效快速的均一化全长cDNA文库构建方法,其特征在于:所述的寡核苷酸引物具体为:
引物序列P1:ACGTATGCACTGACATATA,
引物序列P2:AGTCTACGCTGACGATAGG。
6.根据权利要求1所述的一种高效快速的均一化全长cDNA文库构建方法,其特征在于:所述的锚定引物具体为:
引物序列P1:ACGTACGTACCGACTGATC,
引物序列P2:AGTCTCGGCTAACGATACG,
引物序列P3:AGCTCTAGCTCGAGTAGAG。
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